RNA–Protein interactions for RNA: YER086W

ILV1, Transcript of Threonine deaminase, catalyzes first step in isoleucine biosynthesis, yeast

Gene ILV1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ILV1	YER086W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YBR144C	P34215	104 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YKR045C	P36138	183 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	QDR3	P38227	689 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	GET2	P40056	285 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YJL213W	P40896	331 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YJL163C	P46996	555 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	PAU4	P53427	120 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	AVO2	Q04749	426 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YMR253C	Q04835	414 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	TMA10	Q06177	86 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	MRS3	P10566	314 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	ELO2	P25358	347 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	RIB5	P38145	238 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	LST8	P41318	303 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YJR015W	P47090	510 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	HHO1	P53551	258 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YMR317W	Q04893	1140 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YPS1	P32329	569 aa		5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YAR068W	P39564	161 aa		5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	MIC27	P50945	234 aa		5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YMR007W	Q03675	126 aa		5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	RKI1	Q12189	258 aa		5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YLR415C	O13578	112 aa		5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	PAU1	P0CE88	120 aa		5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	PAU14	P0CE89	120 aa		5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	PAU6	P0CE90	120 aa		5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	PAU18	P0CE91	120 aa		5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	PAU8	P0CE92	120 aa		5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	PAU11	P0CE93	120 aa		5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	PHO85	P17157	305 aa		5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	PAU13	P38725	120 aa		5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	PHS1	P40857	217 aa		5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YGR151C	P53287	111 aa		5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	PAU10	Q03050	120 aa		5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	SHH3	Q04487	196 aa		5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	CTR3	Q06686	241 aa		5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	PAU20	Q08322	120 aa		5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	PAU9	Q3E770	120 aa		5	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	AIM29	P36154	155 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	CSH1	P38287	376 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	SAS2	P40963	338 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YGR018C	P53211	109 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	SNO1	Q03144	224 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YHP1	Q04116	353 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	MCH1	Q07376	486 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	FCY1	Q12178	158 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	SEC59	P20048	519 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YBL071C	P38185	102 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	DER1	P38307	211 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	BDH1	P39714	382 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	TAX4	P47030	604 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	POS5	Q06892	414 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	JID1	Q12350	301 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	HIT1	P46973	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	NDE2	Q07500	545 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	ERV2	Q12284	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YCR022C	P25620	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	SUR2	P38992	349 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	PGD1	P40356	397 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YAR1	P46683	200 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	DIA1	P54005	336 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ILV1	YER086W	COX2	P00410	251 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	LAC1	P28496	418 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	MRPS9	P38120	278 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	DOG2	P38773	246 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	DOG1	P38774	246 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	BNS1	P50084	137 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	LST7	P53237	242 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
ILV1	YER086W	ICS2	P38284	255 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	TRS20	P38334	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	SDH8	P38345	138 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	PTC7	P38797	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ILV1	YER086W	RTS2	P40962	232 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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