RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636773.1

CACNB4-233, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 4,143 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-233	ENST00000636773	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	ABCB6	Q9NP58	842 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	UST	Q9Y2C2	406 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773		A0A1W2PQY0	241 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	HAX1	O00165	279 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	TSPAN9	O75954	239 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	LIFR	P42702	1097 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	GLUD2	P49448	558 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	ALCAM	Q13740	583 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	CASP8	Q14790	479 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	EMC2	Q15006	297 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	SV2C	Q496J9	727 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	HACD3	Q9P035	362 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	GGT7	Q9UJ14	662 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773		A0A087WZ62	844 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	RASA4	O43374	803 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	ATG13	O75143	517 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	LCA5L	O95447	670 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	PRKACB	P22694	351 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	STX17	P56962	302 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	RBP5	P82980	135 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	PTK2	Q05397	1052 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	MTX1	Q13505	466 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	CDH18	Q13634	790 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	CCIN	Q13939	588 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	KRT81	Q14533	505 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	TEAD4	Q15561	434 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	JAML	Q86YT9	394 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	DDI1	Q8WTU0	396 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	SLC39A7	Q92504	469 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	SNX27	Q96L92	541 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	UROC1	Q96N76	676 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	ZIC5	Q96T25	663 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	PXMP2	Q9NR77	195 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	ZMYM6	O95789	1325 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	CEP250	Q9BV73	2442 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	MED7	O43513	233 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	SHMT1	P34896	483 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	RABGGTB	P53611	331 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	IRX4	P78413	519 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	RASEF	Q8IZ41	740 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	GJD3	Q8N144	294 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-233	ENST00000636773	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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