RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623321.3

ATRX-211, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATRX, Length 1,860 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-211ENST00000623321 ZNF618Q5T7W0 954 aa16.08■□□□□ 0.17
ATRX-211ENST00000623321 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
ATRX-211ENST00000623321 TMC3Q7Z5M5 1100 aa16.08■□□□□ 0.17
ATRX-211ENST00000623321 SHC3Q92529 594 aa16.08■□□□□ 0.17
ATRX-211ENST00000623321 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
ATRX-211ENST00000623321 CARD9Q9H257 536 aa16.08■□□□□ 0.17
ATRX-211ENST00000623321 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
ATRX-211ENST00000623321 ERVK-5Q9HDB9 667 aa16.08■□□□□ 0.17
ATRX-211ENST00000623321 OSGEPQ9NPF4 335 aa16.08■□□□□ 0.17
ATRX-211ENST00000623321 DERAQ9Y315 318 aa16.08■□□□□ 0.17
ATRX-211ENST00000623321 HES2Q9Y543 173 aa16.08■□□□□ 0.17
ATRX-211ENST00000623321 TTI1O43156 1089 aa16.08■□□□□ 0.16
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ATRX-211ENST00000623321 C3orf20Q8ND61 904 aa16.08■□□□□ 0.16
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ATRX-211ENST00000623321 SNX27Q96L92 541 aa16.08■□□□□ 0.16
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ATRX-211ENST00000623321 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 MYO1FO00160 1098 aa16.07■□□□□ 0.16
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ATRX-211ENST00000623321 GHRP10912 638 aa16.07■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
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ATRX-211ENST00000623321 TCEAL1Q15170 157 aa16.07■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 SCARA3Q6AZY7 606 aa16.07■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 NLRP14Q86W24 1093 aa16.07■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 MICALL1Q8N3F8 863 aa16.07■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 C1orf127Q8N9H9 656 aa16.07■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa16.07■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 KIF12Q96FN5 646 aa16.07■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa16.07■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 RAB17Q9H0T7 212 aa16.07■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa16.07■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 IPPQ9Y573 584 aa16.07■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 NUB1Q9Y5A7 615 aa16.07■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 DNAH12Q6ZR08 3092 aa16.07■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 ANKRD62A6NC57 917 aa16.06■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 FAM107AO95990 144 aa16.06■□□□□ 0.16
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ATRX-211ENST00000623321 CD52P31358 61 aa16.06■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 CUL2Q13617 745 aa16.06■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
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ATRX-211ENST00000623321 APOL6Q9BWW8 343 aa16.06■□□□□ 0.16
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ATRX-211ENST00000623321 CNTN3Q9P232 1028 aa16.06■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 SIX4Q9UIU6 781 aa16.06■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 CITO14578 2027 aa16.06■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 PPFIA2O75334 1257 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 KIAA0754O94854 1291 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 SGPL1O95470 568 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 KRT19P08727 400 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 TNFAIP3P21580 790 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 FLT3P36888 993 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 USP8P40818 1118 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 LIG3P49916 1009 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 ZBTB6Q15916 424 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 XKR4Q5GH76 650 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 C11orf63Q6NUN7 778 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 RHOT2Q8IXI1 618 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 FAM126BQ8IXS8 530 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 OR2W6PQ8NHA6 318 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 CXorf38Q8TB03 319 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 CCT8L2Q96SF2 557 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 XYLT2Q9H1B5 865 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 RNF39Q9H2S5 420 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 FAM105AQ9NUU6 356 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 DPP3Q9NY33 737 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 PARP2Q9UGN5 583 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 ITGA11Q9UKX5 1188 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 CEP350Q5VT06 3117 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 FAM187AA6NFU0 413 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 ITGB3P05106 788 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 PAEPP09466 180 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 LBX1P52954 281 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 ZNF699Q32M78 642 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 TRAF7Q6Q0C0 670 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 HACE1Q8IYU2 909 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 FAXDC2Q96IV6 333 aa16.05■□□□□ 0.16
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