RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 SUN1O94901 812 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 KRT16P08779 473 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 WEE2P0C1S8 567 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 E2F5Q15329 346 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC38Q5VT99 294 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 ANKRD22Q5VYY1 191 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 DNAJC24Q6P3W2 148 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 FAM47EQ6ZV65 393 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 WDR49Q8IV35 697 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 SLC35B2Q8TB61 432 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 JDP2Q8WYK2 163 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 PICK1Q9NRD5 415 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 ZBTB42B2RXF5 422 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 ALADP13716 330 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 MCL1Q07820 350 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 STXBP2Q15833 593 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 MSS51Q4VC12 460 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 DENND1BQ6P3S1 775 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 TDRPQ86YL5 185 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 NIPA2Q8N8Q9 360 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 JOSD2Q8TAC2 188 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
C9orf170-201ENST00000623052 FAM47DPA6NHR8 397 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 HGSO14964 777 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 PIAS1O75925 651 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 LSM8O95777 96 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 HOXC6P09630 235 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 RPS12P25398 132 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 RXRBP28702 533 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 COPS2P61201 443 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ACCSLQ4AC99 568 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 PTPN20Q4JDL3 420 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 TFDP3Q5H9I0 405 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC91Q7Z6B0 441 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 NCAPGQ9BPX3 1015 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 OTOFQ9HC10 1997 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PPM1 405 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 TJP3O95049 919 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CALB1P05937 261 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 SMTNL2Q2TAL5 461 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 C4orf33Q8N1A6 199 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 PIM2Q9P1W9 311 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 LRRD1A4D1F6 860 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CFAP73A6NFT4 308 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 MAFO75444 373 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ITGAVP06756 1048 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CD48P09326 243 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 RAP1GAPP47736 663 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 PDE4CQ08493 712 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 RIPK1Q13546 671 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 MORF4L2Q15014 288 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 SLC1A5Q15758 541 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 TREML2Q5T2D2 321 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 DCAF15Q66K64 600 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 RNF43Q68DV7 783 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ZPBP2Q6X784 338 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CEP57Q86XR8 500 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ZBED8Q8IZ13 594 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 KLRG1Q96E93 195 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 FOXP3Q9BZS1 431 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 POLIQ9UNA4 740 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 GOLGA8SH3BPF8 625 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ALOX15BO15296 676 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 MAGEB2O15479 319 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 POTEJP0CG39 1038 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 RFC5P40937 340 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ACVR2BQ13705 512 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 MOGSQ13724 837 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 FNBP1LQ5T0N5 605 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM50Q86XT4 487 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms