RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 SNX25Q9H3E2 840 aa22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 AAASQ9NRG9 546 aa22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 DSEQ9UL01 958 aa22.31■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 A8MXQ7 604 aa22.3■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 SOD2P04179 222 aa22.3■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 DNAJB1P25685 340 aa22.3■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 CTNNB1P35222 781 aa22.3■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 ERVK-21P61565 698 aa22.3■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 OVOS1Q6IE37 1185 aa22.3■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.3■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM169Q96HH4 297 aa22.3■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.3■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.3■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 PAEPP09466 180 aa22.29■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 CYP11B1P15538 503 aa22.29■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 PPM1AP35813 382 aa22.29■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 LHX1P48742 406 aa22.29■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 CCZ1BP86790 482 aa22.29■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 CDK17Q00537 523 aa22.29■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 PTK2Q05397 1052 aa22.29■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.29■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 CEP57Q86XR8 500 aa22.29■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 TTC39CQ8N584 583 aa22.29■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 C12orf29Q8N999 325 aa22.29■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.29■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 TTPALQ9BTX7 342 aa22.29■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.29■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.28■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 CARNS1A5YM72 827 aa22.28■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 LILRB3O75022 631 aa22.28■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 SERPING1P05155 500 aa22.28■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 USP41Q3LFD5 358 aa22.28■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 METTL23Q86XA0 190 aa22.28■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 SYT15Q9BQS2 421 aa22.28■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 PLVAPQ9BX97 442 aa22.28■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.28■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.28■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 ADAM12O43184 909 aa22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 FMO1Q01740 532 aa22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 DSG1Q02413 1049 aa22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 KLHL30Q0D2K2 578 aa22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 CAMK1Q14012 370 aa22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 FAM171BQ6P995 826 aa22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 PAQR9Q6ZVX9 377 aa22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 VPS52Q8N1B4 723 aa22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF606Q8WXB4 792 aa22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 PCDHB18PQ96TA0 734 aa22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 ACBD6Q9BR61 282 aa22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 ZBP1Q9H171 429 aa22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 CDH9Q9ULB4 789 aa22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.27■■□□□ 1.16
CSAG3-202ENST00000617158 PTPRDP23468 1912 aa22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 O00370 1275 aa22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 GRM6O15303 877 aa22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 MMEP08473 750 aa22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 OR4Q2P0C623 313 aa22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 VDRP11473 427 aa22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 GNA15P30679 374 aa22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 CDR1P51861 262 aa22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 MTF1Q14872 753 aa22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 RAB30Q15771 203 aa22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 TAF3Q5VWG9 929 aa22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 PALB2Q86YC2 1186 aa22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 SLC30A5Q8TAD4 765 aa22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 AGPAT1Q99943 283 aa22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 MTRRQ9UBK8 725 aa22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms