RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 GTF2BQ00403 316 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 SMARCB1Q12824 385 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 MCM6Q14566 821 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 WDR5BQ86VZ2 330 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 SPPL2BQ8TCT7 592 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 GCNAQ96QF7 691 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC46A2Q9BY10 475 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 CCSER1Q9C0I3 900 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ZMYM5Q9UJ78 669 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 SPAG17Q6Q759 2223 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ACACBO00763 2458 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 TISP43B9A030 160 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKRD63C9JTQ0 380 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 H3BQV1 296 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 CYB561D2O14569 222 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 GDF9O60383 454 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 TBCAO75347 108 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT18P05783 430 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 PLCG1P19174 1290 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 GJB2P29033 226 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 NMT1P30419 496 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 TAF6P49848 677 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 KARSQ15046 597 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 RABEP1Q15276 862 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 TAF12Q16514 161 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 PPM1JQ5JR12 505 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 WSCD1Q658N2 575 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ADALQ6DHV7 355 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 SLFN12LQ6IEE8 588 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 CEP68Q76N32 757 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRTM3Q86VH5 581 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 METTL23Q86XA0 190 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 CMTM8Q8IZV2 173 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 THEM5Q8N1Q8 247 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 GIPC2Q8TF65 315 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 RAD54LQ92698 747 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM83CQ9BQN1 747 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ZHX3Q9H4I2 956 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 DPP3Q9NY33 737 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 STYXL1Q9Y6J8 313 aa11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 EML5Q05BV3 1969 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ATG2BQ96BY7 2078 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 EXTL3O43909 919 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT37O76014 449 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 AVPR1AP37288 418 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 NLRP12P59046 1061 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 GRIN1Q05586 938 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 RUNX3Q13761 415 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 PTPAQ15257 358 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 C8orf34Q49A92 452 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM196Q5HYL7 178 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 PKN3Q6P5Z2 889 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM150AQ86TG1 271 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 EFCAB13Q8IY85 973 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 MAB21L3Q8N8X9 362 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 CHFRQ96EP1 664 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 TMX3Q96JJ7 454 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 KIF9Q9HAQ2 790 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 HPS4Q9NQG7 708 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 GKN1Q9NS71 199 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 CCL26Q9Y258 94 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ZFHX4Q86UP3 3567 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 LAMA1P25391 3075 aa11.12□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 SDK1Q7Z5N4 2213 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 KPNA7A9QM74 516 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 BMP15O95972 392 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 F11P03951 625 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 LONP1P36776 959 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 BFSP1Q12934 665 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 SV2CQ496J9 727 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM68Q6AZZ1 485 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 FSTL4Q6MZW2 842 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 NT5DC4Q86YG4 428 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 RASSF8Q8NHQ8 419 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 GAB3Q8WWW8 586 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms