RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 HEPHQ9BQS7 1158 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM54Q9BYV2 358 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRCC1Q9C099 1032 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAM7Q9H2U9 754 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 WDCPQ9H6R7 721 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 BCAS3Q9H6U6 928 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 MANSC1Q9H8J5 431 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 JADE2Q9NQC1 790 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 CNNM1Q9NRU3 951 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 GGA3Q9NZ52 723 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC39A10Q9ULF5 831 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 HDAC5Q9UQL6 1122 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 GLI3P10071 1580 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 HEG1Q9ULI3 1381 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 NUP188Q5SRE5 1749 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 AOX1Q06278 1338 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SYT5O00445 386 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PHF2O75151 1096 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 REC8O95072 547 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MBD4O95243 580 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 DDX58O95786 925 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 HDCP19113 662 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ITGB7P26010 798 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PRDX5P30044 214 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ECHS1P30084 290 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 RPS16P62249 146 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PRR5P85299 388 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MPP1Q00013 466 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 GRM1Q13255 1194 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SPARCL1Q14515 664 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 UBE3CQ15386 1083 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TAF12Q16514 161 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SKIDA1Q1XH10 827 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MST1LQ2TV78 715 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PRSS36Q5K4E3 855 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 VASNQ6EMK4 673 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF280DQ6N043 979 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM180BQ6P0A1 224 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CFAP161Q6P656 301 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 RPTNQ6XPR3 784 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 GADL1Q6ZQY3 521 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM90A1Q86YD7 464 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 GALNT15Q8N3T1 639 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR48Q8TAF3 677 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SNX33Q8WV41 574 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MAML1Q92585 1016 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SNX21Q969T3 373 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 GDF15Q99988 308 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PDCD2LQ9BRP1 358 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 VPS45Q9NRW7 570 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 HYPKQ9NX55 129 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 KLHL14Q9P2G3 628 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR160Q9UJ42 338 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ADCY9O60503 1353 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PI4KAP2A4QPH2 592 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TISP43B9A030 160 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 B9A039 149 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNQ3O43525 872 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAMTS4O75173 837 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 GDF11O95390 407 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 IL18BPO95998 194 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CD4P01730 458 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 AHSGP02765 367 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MT-ND5P03915 603 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 FTH1P19P0C7X4 201 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CKMT1AP12532 417 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MX1P20591 662 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SDHBP21912 280 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SREBF1P36956 1147 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CD97P48960 835 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PDE1AP54750 535 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PTK2BQ14289 1009 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 RABEP1Q15276 862 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC93Q567U6 631 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 C19orf54Q5BKX5 351 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 BEND3Q5T5X7 828 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MZT2BQ6NZ67 158 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TMC5Q6UXY8 1006 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 BRINP3Q76B58 766 aa4.76□□□□□ -1.65
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