RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 CDHR1Q96JP9 859 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 DRC1Q96MC2 740 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 KLHL5Q96PQ7 755 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 OSBPL9Q96SU4 736 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 EDEM2Q9BV94 578 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 PRORYQ9H606 182 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 LCMT1Q9UIC8 334 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 MTORP42345 2549 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 PCNX2A6NKB5 2137 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 MEIS1O00470 390 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 MSH4O15457 936 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 PSMD10O75832 226 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 ICAM1P05362 532 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 KRT13P13646 458 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 UCHL3P15374 230 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 SLC16A2P36021 539 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 CSRP3P50461 194 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 OAZ1P54368 228 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 RAPGEF1Q13905 1077 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 TCEAL1Q15170 157 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 HGSNATQ68CP4 663 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 MAATS1Q7Z4T9 603 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 CREG2Q8IUH2 290 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 RHOT2Q8IXI1 618 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 MREGQ8N565 214 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 SPATA4Q8NEY3 305 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 LRRC15Q8TF66 581 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 REEP2Q9BRK0 252 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 SEMA4CQ9C0C4 833 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 CPVLQ9H3G5 476 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 ACAD9Q9H845 621 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 CYP39A1Q9NYL5 469 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-218ENST00000584243 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
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GGA3-218ENST00000584243 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 A0A1B0GTL3 188 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 ARHGEF35A5YM69 484 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 GOLGA6L10A6NI86 522 aa8.64□□□□□ -1.03
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GGA3-218ENST00000584243 E9PMD0 336 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 RAD21O60216 631 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 HSF2BPO75031 334 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 MED24O75448 989 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 ERLIN2O94905 339 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 GCNT3O95395 438 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 F2P00734 622 aa8.64□□□□□ -1.03
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GGA3-218ENST00000584243 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 RAP1GAPP47736 663 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 HSD17B4P51659 736 aa8.64□□□□□ -1.03
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GGA3-218ENST00000584243 RPS6KA1Q15418 735 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 CFAP58Q5T655 872 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 H2AFVQ71UI9 128 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 KCNK18Q7Z418 384 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 SFR1Q86XK3 245 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 EFCAB13Q8IY85 973 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 FAM186BQ8IYM0 893 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 ACTRT1Q8TDG2 376 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 KCNN1Q92952 543 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-218ENST00000584243 LRRC45Q96CN5 670 aa8.64□□□□□ -1.03
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