RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579815.1

CLTC-211, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 5

Gene CLTC, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-211ENST00000579815 PKNOX2Q96KN3 472 aa6.84□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 SPAG5Q96R06 1193 aa6.84□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 PNKPQ96T60 521 aa6.84□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.84□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.84□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.84□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.84□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 PARVGQ9HBI0 331 aa6.84□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 JADE2Q9NQC1 790 aa6.84□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 ZNRF3Q9ULT6 936 aa6.84□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 MYH11P35749 1972 aa6.84□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 DOCK1Q14185 1865 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 FITM1A5D6W6 292 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 MAPK13O15264 365 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 LYPLA2O95372 231 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 GCNT3O95395 438 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 MOCS3O95396 460 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 CFBP00751 764 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 RHOXF2BP0C7M4 288 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 MYBP10242 640 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 UCHL3P15374 230 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 FERP16591 822 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 SDHBP21912 280 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 RPS12P25398 132 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 CYP2C19P33261 490 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 ECE1P42892 770 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 CASP8Q14790 479 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 NR0B2Q15466 257 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 NAB2Q15742 525 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 LCE1DQ5T752 114 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 OXR1Q8N573 874 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 GJA10Q969M2 543 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 EXOC4Q96A65 974 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 DYDC2Q96IM9 177 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 MMS19Q96T76 1030 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 MXRA8Q9BRK3 442 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 CD320Q9NPF0 282 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 TBC1D7Q9P0N9 293 aa6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 COL4A5P29400 1685 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 CLRN2A0PK11 232 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 P4HA2O15460 535 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 TLR2O60603 784 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 AKAP3O75969 853 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 SLITRK3O94933 977 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 PON1P27169 355 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 ABCD1P33897 745 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 STAT1P42224 750 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 CASP5P51878 434 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 EPHB4P54760 987 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 NPEPPSP55786 919 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 JAM2P57087 298 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 SNAP25P60880 206 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 PSMC6P62333 389 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 CYP4A11Q02928 519 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 ENPEPQ07075 957 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 CCDC174Q6PII3 467 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.82□□□□□ -1.32
CLTC-211ENST00000579815 ZNF605Q86T29 641 aa6.82□□□□□ -1.32
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