RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-208ENST00000579743 TNMDQ9H2S6 317 aa14.77□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 LMAN1LQ9HAT1 526 aa14.77□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 KIAA1586Q9HCI6 787 aa14.77□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 MTMR6Q9Y217 621 aa14.77□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 ZNF233A6NK53 670 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 PPP6R2O75170 966 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 VNN2O95498 520 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 TNNC2P02585 160 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 ITGB3P05106 788 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 PCSK1P29120 753 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 WEE1P30291 646 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 AVPR1AP37288 418 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 LHX1P48742 406 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 NASPP49321 788 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 AMPD2Q01433 879 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 FCHO2Q0JRZ9 810 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 BFSP1Q12934 665 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 TMEM130Q8N3G9 435 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 IQUBQ8NA54 791 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 BPIFB1Q8TDL5 484 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 ACBD6Q9BR61 282 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 CHRDQ9H2X0 955 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.76□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.75□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 SOBPA7XYQ1 873 aa14.75□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 SOAT2O75908 522 aa14.75□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 CSH1P0DML2 217 aa14.75□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 CSH2P0DML3 217 aa14.75□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 SDHBP21912 280 aa14.75□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 CCNE1P24864 410 aa14.75□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 MTAPQ13126 283 aa14.75□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.75□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 GAREM2Q75VX8 874 aa14.75□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 LINC00301Q8NCQ3 95 aa14.75□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 LPIN3Q9BQK8 851 aa14.75□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 BACH2Q9BYV9 841 aa14.75□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.75□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 ABCB6Q9NP58 842 aa14.75□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 GOLGA8IPA6NC78 632 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 GOLGA8JA6NMD2 632 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 CUTAO60888 179 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 YEATS4O95619 227 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 CXCL12P48061 93 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 ASIC1P78348 528 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 KCNA1Q09470 495 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 POTEHQ6S545 545 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 DPH6Q7L8W6 267 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 HSCBQ8IWL3 235 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 TTC9BQ8N6N2 239 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 TOP6BLQ8N6T0 577 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 ZBTB44Q8NCP5 570 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 GIPC2Q8TF65 315 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 GMEB2Q9UKD1 530 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 SNX9Q9Y5X1 595 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 TCHHQ07283 1943 aa14.74□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 ATF6P18850 670 aa14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 CASP5P51878 434 aa14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 STXBP5Q5T5C0 1151 aa14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 C4orf50Q6ZRC1 276 aa14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 SYNPOQ8N3V7 929 aa14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 SPEM1Q8N4L4 309 aa14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 C1orf127Q8N9H9 656 aa14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 FSIP1Q8NA03 581 aa14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 SUMF1Q8NBK3 374 aa14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 FNBP1Q96RU3 617 aa14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 CBWD1Q9BRT8 395 aa14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 PI4K2AQ9BTU6 479 aa14.73□□□□□ -0.05
GGA3-208ENST00000579743 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms