RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 ZWILCHQ9H900 591 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SLC6A20Q9NP91 592 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CD93Q9NPY3 652 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PARPBPQ9NWS1 579 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 RRN3Q9NYV6 651 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CEP72Q9P209 647 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF112Q9UJU3 913 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 GRID1Q9ULK0 1009 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 HPCAL4Q9UM19 191 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PHTF1Q9UMS5 762 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 FAM50BQ9Y247 325 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PTPN22Q9Y2R2 807 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF711Q9Y462 761 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CD2APQ9Y5K6 639 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PEG3Q9GZU2 1588 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1B0GVC2 190 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM191CA6NGB0 347 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 H0Y626 953 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SGK1O00141 431 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ERC2O15083 957 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 FOXN1O15353 648 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TTI1O43156 1089 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 KLF4O43474 513 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 NEBLO76041 1014 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ASMTLO95671 621 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PRLRP16471 622 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 FAHP16930 419 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 BMP5P22003 454 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PRKAR1BP31321 381 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SOX5P35711 763 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ECI1P42126 302 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 STAT1P42224 750 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 IL12RB1P42701 662 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PSMC4P43686 418 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PHKA1P46020 1223 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TM4SF4P48230 202 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CLCN2P51788 898 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SLC12A2P55011 1212 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 DR1Q01658 176 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 HHEXQ03014 270 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 RUNX1T1Q06455 604 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 DUSP8Q13202 625 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TCIRG1Q13488 830 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 LAMB3Q13751 1172 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 DPYSQ14117 519 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 NEDD9Q14511 834 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 NCAPHQ15003 741 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 C5orf22Q49AR2 442 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 METTL11BQ5VVY1 283 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CORO6Q6QEF8 472 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MFSD6Q6ZSS7 791 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 IKBIPQ70UQ0 350 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SPATA21Q7Z572 469 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 VSIG1Q86XK7 387 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 EPHX4Q8IUS5 362 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 COLGALT2Q8IYK4 626 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 NRSN1Q8IZ57 195 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SMYD1Q8NB12 490 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SPATA5Q8NB90 893 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 BBOF1Q8ND07 529 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MDM1Q8TC05 714 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PARD3BQ8TEW8 1205 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TCP11Q8WWU5 503 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CLEC4DQ8WXI8 215 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CCT6BQ92526 530 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SHC3Q92529 594 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D5Q92609 795 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CDKL2Q92772 493 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 FATE1Q969F0 183 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R14AQ96A00 147 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MIEF2Q96C03 454 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MTMR8Q96EF0 704 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MFSD3Q96ES6 412 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 FAXDC2Q96IV6 333 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CAMKK2Q96RR4 588 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R9BQ96SB3 815 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 RMDN3Q96TC7 470 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MPHOSPH8Q99549 860 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 DPYSL5Q9BPU6 564 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 DESI2Q9BSY9 194 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 FSD1Q9BTV5 496 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PLA2G12BQ9BX93 195 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SLC26A6Q9BXS9 759 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 NACAP1Q9BZK3 213 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TSGA10Q9BZW7 698 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 BRD8Q9H0E9 1235 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MROH8Q9H579 483 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms