RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 CD19P15391 556 aa24.5■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 ARHGAP1Q07960 439 aa24.5■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 ZNF667Q5HYK9 610 aa24.5■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa24.5■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 ARMCX2Q7L311 632 aa24.5■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 GSTA5Q7RTV2 222 aa24.5■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 PRUNE1Q86TP1 453 aa24.5■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 SHCBP1Q8NEM2 672 aa24.5■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 IFT122Q9HBG6 1241 aa24.5■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 NINJ2Q9NZG7 142 aa24.5■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 TJP3O95049 919 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 DRD4P21917 467 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 PTPN7P35236 360 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 PHKA2P46019 1235 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 COPS2P61201 443 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 LMNB2Q03252 620 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 KYNUQ16719 465 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 PTPN20Q4JDL3 420 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 ZNF484Q5JVG2 852 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 C6orf89Q6UWU4 347 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 TMEM130Q8N3G9 435 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 C1orf127Q8N9H9 656 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 SERPINB12Q96P63 405 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 EFCC1Q9HA90 598 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 DNPEPQ9ULA0 475 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 STRIP2Q9ULQ0 834 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 LACTBL1A8MY62 500 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 INSRRP14616 1297 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 LIG3P49916 1009 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 FAM187BQ17R55 369 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 OTUD6BQ8N6M0 293 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 CHMP6Q96FZ7 201 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 SDCBP2Q9H190 292 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 LHX5Q9H2C1 402 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 CYTH4Q9UIA0 394 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa24.49■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa24.48■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 MED7O43513 233 aa24.48■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 LGALS2P05162 132 aa24.48■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 STAG3L1P0CL83 205 aa24.48■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 RAD23BP54727 409 aa24.48■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 CCDC38Q502W7 563 aa24.48■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 TAOK1Q7L7X3 1001 aa24.48■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.48■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 CPP00450 1065 aa24.47■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 GJA5P36382 358 aa24.47■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 CDH8P55286 799 aa24.47■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 POU5F1BQ06416 359 aa24.47■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 AMHR2Q16671 573 aa24.47■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 P3H1Q32P28 736 aa24.47■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 WDR72Q3MJ13 1102 aa24.47■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 JADE1Q6IE81 842 aa24.47■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 EXOC3L1Q86VI1 746 aa24.47■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 SEC16BQ96JE7 1060 aa24.47■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 TJP2Q9UDY2 1190 aa24.47■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 GOLGA8SH3BPF8 625 aa24.47■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 MCF2P10911 925 aa24.47■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 IFT88Q13099 833 aa24.47■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 LINC01465Q8N7H1 131 aa24.47■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 SMYD3Q9H7B4 428 aa24.47■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 A0A087WZ62 844 aa24.46■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 LRRD1A4D1F6 860 aa24.46■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 SIGLEC16A6NMB1 481 aa24.46■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 CDKN2BP42772 138 aa24.46■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 TNFAIP2Q03169 654 aa24.46■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 LAMC2Q13753 1193 aa24.46■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 TFDP3Q5H9I0 405 aa24.46■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 CPLX4Q7Z7G2 160 aa24.46■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 RELL1Q8IUW5 271 aa24.46■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 MICALL1Q8N3F8 863 aa24.46■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 ALLCQ8N6M5 410 aa24.46■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 GLIS1Q8NBF1 620 aa24.46■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 CCHCR1Q8TD31 782 aa24.46■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 PPP1R16BQ96T49 567 aa24.46■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 PDZD7Q9H5P4 517 aa24.46■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 ZNF148Q9UQR1 794 aa24.46■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 ITGB3P05106 788 aa24.45■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 CYP2C8P10632 490 aa24.45■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 PSMA2P25787 234 aa24.45■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 ORC1Q13415 861 aa24.45■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 TAPT1Q6NXT6 567 aa24.45■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 SLC4A11Q8NBS3 891 aa24.45■■□□□ 1.51
EHD4-202ENST00000569223 JOSD2Q8TAC2 188 aa24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms