RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	CXCL8	P10145	99 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	GNA15	P30679	374 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	PEX5	P50542	639 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	PAK2	Q13177	524 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	SHH	Q15465	462 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM240	Q5SV17	173 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	ZBBX	A8MT70	800 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	MYBL1	P10243	752 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	NOMO3	P69849	1222 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	DEFB103A	P81534	67 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	EMB	Q6PCB8	327 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	MON1B	Q7L1V2	547 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF410	Q86VK4	478 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CAVIN3	Q969G5	261 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	ZBTB9	Q96C00	473 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	NR2E1	Q9Y466	385 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	IL18RAP	O95256	599 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	TNNC2	P02585	160 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	MCF2	P10911	925 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	RRM1	P23921	792 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CTNNA2	P26232	953 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	GPS2	Q13227	327 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	TRPC3	Q13507	836 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	TRADD	Q15628	312 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	AADACL2	Q6P093	401 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	PASD1	Q8IV76	773 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	TRIM11	Q96F44	468 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CDH23	Q9H251	3354 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-231	ENST00000566279	CIT	O14578	2027 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	THAP12	O43422	761 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	SPOP	O43791	374 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	FGB	P02675	491 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	NFIC	P08651	508 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	STAG3L1	P0CL83	205 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	ASPA	P45381	313 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	NNT	Q13423	1086 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF699	Q32M78	642 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	IFT81	Q8WYA0	676 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	TRIM7	Q9C029	511 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	CISH	Q9NSE2	258 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	SIX4	Q9UIU6	781 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	NFU1	Q9UMS0	254 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	GBF1	Q92538	1859 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	LACTBL1	A8MY62	500 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	TSPAN1	O60635	241 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	CD58	P19256	250 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	RFC2	P35250	354 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	TERF2	Q15554	542 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	C2CD6	Q53TS8	623 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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