RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	ALOX15B	O15296	676 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	TGFB3	P10600	412 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	CDKN2B	P42772	138 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	MYL6	P60660	151 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	BNIP1	Q12981	228 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	ACVR2B	Q13705	512 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC142	Q17RM4	750 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	SEZ6	Q53EL9	994 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	RNF43	Q68DV7	783 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	KLRG1	Q96E93	195 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	PCYT2	Q99447	389 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		19.42	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	LCT	P09848	1927 aa		19.41	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	LRRD1	A4D1F6	860 aa		19.41	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	NFKBIE	O00221	500 aa		19.41	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6V1G2	O95670	118 aa		19.41	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	19.41	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	TCF4	P15884	667 aa		19.41	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	19.41	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	19.41	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	TTC13	Q8NBP0	860 aa		19.41	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		19.41	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	19.41	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		19.41	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	ECT2	Q9H8V3	914 aa		19.41	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		19.41	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		19.41	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEB2	O15479	319 aa		19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	KRT7	P08729	469 aa		19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	TAC1	P20366	129 aa		19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	TNFSF9	P41273	254 aa		19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	PLCB3	Q01970	1234 aa		19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	CNTN2	Q02246	1040 aa		19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	MAPK6	Q16659	721 aa		19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB33	Q86T24	672 aa		19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	NCALD	P61601	193 aa		19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	OGDH	Q02218	1023 aa		19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	SPARCL1	Q14515	664 aa		19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	FAM228A	Q86W67	206 aa		19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	SMC6	Q96SB8	1091 aa		19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	19.4	■□□□□ 0.7
RRN3-205	ENST00000563559	SGK1	O00141	431 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	MED7	O43513	233 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ASMTL	O95671	621 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	NF2	P35240	595 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	MAP2K2	P36507	400 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF699	Q32M78	642 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	CEP57	Q86XR8	500 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	LHX5	Q9H2C1	402 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	TRABD	Q9H4I3	376 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	NOD2	Q9HC29	1040 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	FETUB	Q9UGM5	382 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	TNNC2	P02585	160 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	PRKCB	P05771	671 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	KRT15	P19012	456 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	EDNRB	P24530	442 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	GCA	P28676	217 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF394	Q53GI3	561 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	METTL7B	Q6UX53	244 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		19.39	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		19.38	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		19.38	■□□□□ 0.69

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