RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 TCF7L1Q9HCS4 588 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 PDE7BQ9NP56 450 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 TBCCD1Q9NVR7 557 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 NMRK1Q9NWW6 199 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 EHD3Q9NZN3 535 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 STOML1Q9UBI4 398 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 AMACRQ9UHK6 382 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 SATB2Q9UPW6 733 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 CFL2Q9Y281 166 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa5.85□□□□□ -1.47
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CAPN3-211ENST00000562199 RGSL1A5PLK6 1076 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 KRT87PA6NCN2 255 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 GOLGA8BA8MQT2 603 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 E9PMD0 336 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 FSCN2O14926 492 aa5.85□□□□□ -1.47
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CAPN3-211ENST00000562199 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
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CAPN3-211ENST00000562199 GTF2H3Q13889 308 aa5.85□□□□□ -1.47
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CAPN3-211ENST00000562199 DOC2AQ14183 400 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 DUOXA2Q1HG44 320 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 MEI1Q5TIA1 1274 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 FYB2Q5VWT5 728 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 GGT6Q6P531 493 aa5.85□□□□□ -1.47
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CAPN3-211ENST00000562199 ZNF438Q7Z4V0 828 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 CABP7Q86V35 215 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 TMTC1Q8IUR5 882 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 WDR49Q8IV35 697 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 CEP97Q8IW35 865 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 SLC15A3Q8IY34 581 aa5.85□□□□□ -1.47
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CAPN3-211ENST00000562199 ZNF565Q8N9K5 539 aa5.85□□□□□ -1.47
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CAPN3-211ENST00000562199 PPP2R3CQ969Q6 453 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 LRGUKQ96M69 825 aa5.85□□□□□ -1.47
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CAPN3-211ENST00000562199 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 CCT7Q99832 543 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 CDK19Q9BWU1 502 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 STK31Q9BXU1 1019 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 NIF3L1Q9GZT8 377 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 BHMT2Q9H2M3 363 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 EHMT1Q9H9B1 1298 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 HSPBP1Q9NZL4 362 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 MBD2Q9UBB5 411 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 AASSQ9UDR5 926 aa5.85□□□□□ -1.47
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CAPN3-211ENST00000562199 RASAL2Q9UJF2 1139 aa5.85□□□□□ -1.47
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CAPN3-211ENST00000562199 LRCH1Q9Y2L9 728 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 PTPN22Q9Y2R2 807 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 FMN2Q9NZ56 1722 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 OVOS2Q6IE36 1432 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 A6NHS1 94 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 ACOD1A6NK06 481 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 A6NLC8 198 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 FAM177BA6PVY3 158 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 TISP43B9A030 160 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-211ENST00000562199 B9A039 149 aa5.84□□□□□ -1.47
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