RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF699Q32M78 642 aa22.43■■□□□ 1.18
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TMOD3-203ENST00000558455 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.43■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.43■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.43■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.43■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 CEP72Q9P209 647 aa22.43■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
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TMOD3-203ENST00000558455 SOAT2O75908 522 aa22.42■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 CLSTN1O94985 981 aa22.42■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 RHOP08100 348 aa22.42■■□□□ 1.18
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TMOD3-203ENST00000558455 GCLMP48507 274 aa22.42■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 SMARCB1Q12824 385 aa22.42■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 ELMOD1Q8N336 334 aa22.42■■□□□ 1.18
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TMOD3-203ENST00000558455 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.42■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.42■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.42■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.42■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.42■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.41■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 ALADP13716 330 aa22.41■■□□□ 1.18
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TMOD3-203ENST00000558455 CCDC142Q17RM4 750 aa22.41■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 TTI2Q6NXR4 508 aa22.41■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 ITFG1Q8TB96 612 aa22.41■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 PKMYT1Q99640 499 aa22.41■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 CORO1BQ9BR76 489 aa22.41■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.41■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 TACC1O75410 805 aa22.4■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 HLA-DRAP01903 254 aa22.4■■□□□ 1.18
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TMOD3-203ENST00000558455 ALDH1A3P47895 512 aa22.4■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 PTPN21Q16825 1174 aa22.4■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.4■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.4■■□□□ 1.18
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.4■■□□□ 1.18
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TMOD3-203ENST00000558455 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.4■■□□□ 1.18
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TMOD3-203ENST00000558455 ATP2C2O75185 946 aa22.39■■□□□ 1.17
TMOD3-203ENST00000558455 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TMOD3-203ENST00000558455 PDGFRBP09619 1106 aa22.39■■□□□ 1.17
TMOD3-203ENST00000558455 GTF2H1P32780 548 aa22.39■■□□□ 1.17
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TMOD3-203ENST00000558455 EPHB3P54753 998 aa22.39■■□□□ 1.17
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TMOD3-203ENST00000558455 PAK1Q13153 545 aa22.39■■□□□ 1.17
TMOD3-203ENST00000558455 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
TMOD3-203ENST00000558455 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.39■■□□□ 1.17
TMOD3-203ENST00000558455 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.39■■□□□ 1.17
TMOD3-203ENST00000558455 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.39■■□□□ 1.17
TMOD3-203ENST00000558455 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.39■■□□□ 1.17
TMOD3-203ENST00000558455 ING5Q8WYH8 240 aa22.39■■□□□ 1.17
TMOD3-203ENST00000558455 FGF13Q92913 245 aa22.39■■□□□ 1.17
TMOD3-203ENST00000558455 CEP63Q96MT8 703 aa22.39■■□□□ 1.17
TMOD3-203ENST00000558455 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.39■■□□□ 1.17
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TMOD3-203ENST00000558455 CDH7Q9ULB5 785 aa22.39■■□□□ 1.17
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TMOD3-203ENST00000558455 FAM163BP0C2L3 166 aa22.38■■□□□ 1.17
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TMOD3-203ENST00000558455 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TMOD3-203ENST00000558455 STX17P56962 302 aa22.38■■□□□ 1.17
TMOD3-203ENST00000558455 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
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TMOD3-203ENST00000558455 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.38■■□□□ 1.17
TMOD3-203ENST00000558455 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.38■■□□□ 1.17
TMOD3-203ENST00000558455 TAF4BQ92750 862 aa22.38■■□□□ 1.17
TMOD3-203ENST00000558455 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.38■■□□□ 1.17
TMOD3-203ENST00000558455 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.38■■□□□ 1.17
TMOD3-203ENST00000558455 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 61.5
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