RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556591.1

CFAP54-208, Transcript of cilia and flagella associated protein 54, human

TSL 5

Gene CFAP54, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	AMER2	Q8N7J2	671 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	C8orf48	Q96LL4	319 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	PRRX2	Q99811	253 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	HESX1	Q9UBX0	185 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	MYO1F	O00160	1098 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	BTN3A1	O00481	513 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	DCLK1	O15075	740 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	TBX3	O15119	743 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	HRG	P04196	525 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	HKR1	P10072	659 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	RHCE	P18577	417 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC11A2	P49281	568 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	RHD	Q02161	417 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	FOXI1	Q12951	378 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	CTBP1	Q13363	440 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	LNX2	Q8N448	690 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	CAVIN3	Q969G5	261 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	XPR1	Q9UBH6	696 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	RAMP2	O60895	175 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	TH	P07101	528 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	PPP3CB	P16298	524 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	ITGAL	P20701	1170 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	PLA2G5	P39877	138 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	MPL	P40238	635 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	NDUFV1	P49821	464 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF134	P52741	427 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	SEC24C	P53992	1094 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	CACNB3	P54284	484 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	TAP1	Q03518	808 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	DPT	Q07507	201 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	LONRF3	Q496Y0	759 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC15A4	Q8N697	577 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	LPIN2	Q92539	896 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	MRI	Q9BWK5	157 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	STK32B	Q9NY57	414 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	TMX2	Q9Y320	296 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591		A0A0B4J269	797 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM233	B4DJY2	109 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	GOLIM4	O00461	696 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	TBC1D4	O60343	1298 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	GC	P02774	474 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	SRGN	P10124	158 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	MYF5	P13349	255 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	BRAF	P15056	766 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	TGM1	P22735	817 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	PEX2	P28328	305 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	AVPR1B	P47901	424 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	INHBC	P55103	352 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	TGFB2	P61812	414 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM193A	P78312	1265 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC13A2	Q13183	592 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	TUBB3	Q13509	450 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	IQCB1	Q15051	598 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591		Q6ZNX1	250 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	GPR150	Q8NGU9	434 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	MAML1	Q92585	1016 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	CHFR	Q96EP1	664 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	COQ10A	Q96MF6	247 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	APOL5	Q9BWW9	433 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	DPH1	Q9BZG8	443 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CFAP54-208	ENST00000556591	MAST3	O60307	1309 aa		5.73	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms