RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	C8orf76	Q96K31	380 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	JADE2	Q9NQC1	790 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	LTBP2	Q14767	1821 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ELP1	O95163	1332 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	BTBD18	B2RXH4	712 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CTAGE5	O15320	804 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	MAFG	O15525	162 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CHMP2A	O43633	222 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	FUCA1	P04066	466 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CYP2C9	P11712	490 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CYP2C18	P33260	490 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ERVFRD-1	P60508	538 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNAB2	Q13303	367 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CEP55	Q53EZ4	464 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM209A	Q5JX71	171 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT40	Q6A162	431 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	GALNT17	Q6IS24	598 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	GJA10	Q969M2	543 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	AZI2	Q9H6S1	392 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ARID2	Q68CP9	1835 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ESYT2	A0FGR8	921 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	BLACE	A4D250	179 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	NUDT19	A8MXV4	375 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM86B1	E9PN63	330 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	B4GALT4	O60513	344 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	GAS7	O60861	476 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	TIMP1	P01033	207 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	LGALS2	P05162	132 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	LCP1	P13796	627 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	GJB2	P29033	226 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ICAM3	P32942	547 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	SREBF1	P36956	1147 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	MCM2	P49736	904 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CDK7	P50613	346 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	STAT5B	P51692	787 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ACTR2	P61160	394 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	GHRHR	Q02643	423 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	FPGS	Q05932	587 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF174	Q15697	407 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	METTL7B	Q6UX53	244 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	CABP7	Q86V35	215 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	LILRB2	Q8N423	598 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM199	Q8N511	208 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	PPTC7	Q8NI37	304 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	SCLY	Q96I15	445 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	TMX3	Q96JJ7	454 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR20	Q99678	358 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	HIPK3	Q9H422	1215 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-238	ENST00000556288	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		5.22	□□□□□ -1.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms