RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549940.5

GNPTAB-206, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 1,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-206ENST00000549940 CPA5Q8WXQ8 436 aa29.44■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 NOX5Q96PH1 765 aa29.44■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 FAM170AA1A519 330 aa29.44■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 UPP2O95045 317 aa29.44■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 CFHP08603 1231 aa29.44■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 STILQ15468 1287 aa29.44■■■□□ 2.3
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GNPTAB-206ENST00000549940 WSCD1Q658N2 575 aa29.44■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 KIF18AQ8NI77 898 aa29.44■■■□□ 2.3
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GNPTAB-206ENST00000549940 ZSWIM1Q9BR11 485 aa29.44■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa29.44■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa29.44■■■□□ 2.3
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GNPTAB-206ENST00000549940 TBKBP1A7MCY6 615 aa29.43■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 PDGFRBP09619 1106 aa29.43■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 GATMP50440 423 aa29.43■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 NOMO3P69849 1222 aa29.43■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 GPC5P78333 572 aa29.43■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 CENPCQ03188 943 aa29.43■■■□□ 2.3
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GNPTAB-206ENST00000549940 THAP2Q9H0W7 228 aa29.43■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
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GNPTAB-206ENST00000549940 AMHP03971 560 aa29.42■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 NOP2P46087 812 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
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GNPTAB-206ENST00000549940 METTL23Q86XA0 190 aa29.42■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 HASPINQ8TF76 798 aa29.42■■■□□ 2.3
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GNPTAB-206ENST00000549940 ALS2CR12Q96Q35 445 aa29.42■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 DSEQ9UL01 958 aa29.42■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 KIF4AO95239 1232 aa29.41■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 CASQ1P31415 396 aa29.41■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 CRYBG2Q8N1P7 616 aa29.41■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 TRIM58Q8NG06 486 aa29.41■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 LHX5Q9H2C1 402 aa29.41■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 BUB1O43683 1085 aa29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 MOCS3O95396 460 aa29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 LMO2P25791 158 aa29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 SLC35F6Q8N357 371 aa29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 RFFLQ8WZ73 363 aa29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 WDR24Q96S15 920 aa29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 IL23AQ9NPF7 189 aa29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 DNAJB4Q9UDY4 337 aa29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 O00370 1275 aa29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 GABRDO14764 452 aa29.4■■■□□ 2.3
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GNPTAB-206ENST00000549940 ALDH2P05091 517 aa29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 BRCC3P46736 316 aa29.4■■■□□ 2.3
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GNPTAB-206ENST00000549940 C12orf29Q8N999 325 aa29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 SPATA18Q8TC71 538 aa29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 ZNF653Q96CK0 615 aa29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 SUSD3Q96L08 255 aa29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 SALL4Q9UJQ4 1053 aa29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 NME7Q9Y5B8 376 aa29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 I3L4J1 428 aa29.39■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 M0QZQ0 153 aa29.39■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 TRAPPC3O43617 180 aa29.39■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 MYBL1P10243 752 aa29.39■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 ACRP10323 421 aa29.39■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP29.39■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 CD300LGQ6UXG3 332 aa29.39■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 OSTM1Q86WC4 334 aa29.39■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 RHOT2Q8IXI1 618 aa29.39■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 MCOLN2Q8IZK6 566 aa29.39■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 VCPIP1Q96JH7 1222 aa29.39■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 DPEP3Q9H4B8 488 aa29.39■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 ADAM22Q9P0K1 906 aa29.39■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
GNPTAB-206ENST00000549940 NCANO14594 1321 aa29.39■■■□□ 2.29
GNPTAB-206ENST00000549940 M0QYV0 167 aa29.38■■■□□ 2.29
GNPTAB-206ENST00000549940 TADA2AO75478 443 aa29.38■■■□□ 2.29
GNPTAB-206ENST00000549940 BAIAP3O94812 1187 aa29.38■■■□□ 2.29
GNPTAB-206ENST00000549940 MICAL2O94851 1124 aa29.38■■■□□ 2.29
GNPTAB-206ENST00000549940 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
GNPTAB-206ENST00000549940 LIN9Q5TKA1 542 aa29.38■■■□□ 2.29
GNPTAB-206ENST00000549940 DENND1BQ6P3S1 775 aa29.38■■■□□ 2.29
GNPTAB-206ENST00000549940 LCLAT1Q6UWP7 414 aa29.38■■■□□ 2.29
GNPTAB-206ENST00000549940 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
GNPTAB-206ENST00000549940 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
GNPTAB-206ENST00000549940 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
GNPTAB-206ENST00000549940 SLC35G2Q8TBE7 412 aa29.38■■■□□ 2.29
GNPTAB-206ENST00000549940 TOP1MTQ969P6 601 aa29.38■■■□□ 2.29
GNPTAB-206ENST00000549940 COLEC11Q9BWP8 271 aa29.38■■■□□ 2.29
GNPTAB-206ENST00000549940 GTF3C4Q9UKN8 822 aa29.38■■■□□ 2.29
GNPTAB-206ENST00000549940 TSPAN16Q9UKR8 245 aa29.38■■■□□ 2.29
GNPTAB-206ENST00000549940 ARHGEF26Q96DR7 871 aa29.37■■■□□ 2.29
GNPTAB-206ENST00000549940 TMEM175Q9BSA9 504 aa29.37■■■□□ 2.29
GNPTAB-206ENST00000549940 FAM49BQ9NUQ9 324 aa29.37■■■□□ 2.29
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