RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 JMJD4Q9H9V9 463 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MYOM1P52179 1685 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 RSPH10B2B2RC85 870 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SNAP23O00161 211 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 HLA-DRAP01903 254 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 RSPH10BP0C881 870 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SREBF1P36956 1147 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SERPINB10P48595 397 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CLCN6P51797 869 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ARFIP2P53365 341 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CDH18Q13634 790 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 LRIG3Q6UXM1 1119 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CCNJLQ8IV13 435 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CYTH2Q99418 400 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ADGRE3Q9BY15 652 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CYP3A43Q9HB55 503 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 F5H5T6 163 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 H0Y626 953 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 OGTO15294 1046 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NCAM2O15394 837 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CDH16O75309 829 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 KLHL2O95198 593 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 URODP06132 367 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 KITP10721 976 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 POTEAQ6S8J7 498 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NIPA1Q7RTP0 329 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SLC20A1Q8WUM9 679 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SNX12Q9UMY4 172 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 RGPD5Q99666 1765 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 HPCAP84074 193 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CREMQ03060 361 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 FLOT2Q14254 428 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PLA2G4FQ68DD2 849 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CENPPQ6IPU0 288 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SEPT8Q92599 483 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ADGRB2O60241 1585 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MSCO60682 206 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TRPA1O75762 1119 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 AGTP01019 485 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM49P0CI25 452 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM49CP0CI26 452 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 KCNA2P16389 499 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NCALDP61601 193 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NR1I3Q14994 352 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NCAPHQ15003 741 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ELMO2Q96JJ3 720 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ADGRG1Q9Y653 693 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 RPS6P62753 249 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 FAM83EQ2M2I3 478 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 BOLA3Q53S33 107 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ADSSL1Q8N142 457 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SKA1Q96BD8 255 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CLMNQ96JQ2 1002 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SMYD3Q9H7B4 428 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 VTA1Q9NP79 307 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PXMP2Q9NR77 195 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CDYLQ9Y232 598 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 HAUS5O94927 633 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CTSHP09668 335 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CNTFP26441 200 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TFDP3Q5H9I0 405 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 FKBP1CQ5VVH2 108 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NFRKBQ6P4R8 1299 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SPATA4Q8NEY3 305 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms