RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 PSMD6Q15008 389 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 KRBA2Q6ZNG9 492 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 NELFCDQ8IXH7 590 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 YAF2Q8IY57 180 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 RDH13Q8NBN7 331 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC26Q8TAB7 109 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TAF4BQ92750 862 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SMARCE1Q969G3 411 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 MSANTD3Q96H12 275 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 HPDLQ96IR7 371 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TNIP3Q96KP6 325 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TIGD1Q96MW7 591 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 NELL2Q99435 816 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CGRRF1Q99675 332 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CORO1BQ9BR76 489 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ZFP14Q9HCL3 533 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 INTS13Q9NVM9 706 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 GDAP2Q9NXN4 497 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
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CLSTN3-215ENST00000544584 INSL5Q9Y5Q6 135 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SNX9Q9Y5X1 595 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 BICDL2A1A5D9 508 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 I3L4J1 428 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 MAN2B1O00754 1011 aa6.01□□□□□ -1.45
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CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM66O15016 1216 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CETN3O15182 167 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 TBC1D4O60343 1298 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ECI2O75521 394 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 WEE2P0C1S8 567 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CSH1P0DML2 217 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CSH2P0DML3 217 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 GLULP15104 373 aa6.01□□□□□ -1.45
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CLSTN3-215ENST00000544584 SLC8A3P57103 927 aa6.01□□□□□ -1.45
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CLSTN3-215ENST00000544584 CYP24A1Q07973 514 aa6.01□□□□□ -1.45
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CLSTN3-215ENST00000544584 SCFD1Q8WVM8 642 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 FGF13Q92913 245 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 IRF7Q92985 503 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 BLZF1Q9H2G9 400 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CACNG4Q9UBN1 327 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CDH9Q9ULB4 789 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 HPSEQ9Y251 543 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6□□□□□ -1.45
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