RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538351.6

ZNF438-208, Transcript of zinc finger protein 438, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF438, Length 3,284 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF438-208	ENST00000538351	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	STAT2	P52630	851 aa		8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	CDK16	Q00536	496 aa		8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	MTMR2	Q13614	643 aa		8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	SLC1A5	Q15758	541 aa		8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	AADACL2	Q6P093	401 aa		8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	TTC27	Q6P3X3	843 aa		8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	SGF29	Q96ES7	293 aa		8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		8.26	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351		J3QRK9	145 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	PSMD11	O00231	422 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	TOM1	O60784	492 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	SULT1C4	O75897	302 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	BBOX1	O75936	387 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	P4HA1	P13674	534 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	IRX4	P78413	519 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	WDR78	Q5VTH9	848 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	XKR5	Q6UX68	686 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	GIPC2	Q8TF65	315 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	FBXL8	Q96CD0	374 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC77	Q9BR77	488 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	HAUS8	Q9BT25	410 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	NUF2	Q9BZD4	464 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	AAAS	Q9NRG9	546 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	POTEC	B2RU33	542 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	CRTAM	O95727	393 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC130	P13994	396 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	RAG1	P15918	1043 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	PDE6A	P16499	860 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	JAK1	P23458	1154 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	BTD	P43251	543 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC58	Q4VC31	144 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	H2AFV	Q71UI9	128 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	NATD1	Q8N6N6	113 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	PRELID2	Q8N945	189 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	ATP2A3	Q93084	1043 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	TRABD	Q9H4I3	376 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	FLT1	P17948	1338 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	IGKV5-2	P06315	115 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	GLUL	P15104	373 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	KRT15	P19012	456 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	IST1	P53990	364 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	NR1H3	Q13133	447 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	PDK1	Q15118	436 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	CEP63	Q96MT8	703 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	RANBP9	Q96S59	729 aa		8.25	□□□□□ -1.09
ZNF438-208	ENST00000538351	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		8.25	□□□□□ -1.09

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms