RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527680.1

TRAPPC4-208, Transcript of trafficking protein particle complex 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC4, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4-208ENST00000527680 AGAP1Q9UPQ3 857 aa24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 GOLGA8IPA6NC78 632 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 GOLGA8JA6NMD2 632 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 ARNTLO00327 626 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 CHRNB1P11230 501 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 CXCL12P48061 93 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 SOX9P48436 509 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 CCR3P51677 355 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 TSPY1Q01534 308 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 C1orf228Q6PIY5 440 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 MSANTD3Q96H12 275 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 MKNK1Q9BUB5 465 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 ZNF292O60281 2723 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 HUS1O60921 280 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 LILRB5O75023 590 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 ITGB3P05106 788 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 KRT19P08727 400 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 ATF6P18850 670 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 LRRC32Q14392 662 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 SLC39A14Q15043 492 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 MAMSTRQ6ZN01 415 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 PDILTQ8N807 584 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 BPIFB1Q8TDL5 484 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 NELL1Q92832 810 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 LRRC3BQ96PB8 259 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 USP28Q96RU2 1077 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 PCIF1Q9H4Z3 704 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 OBP2AQ9NY56 170 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 GTSE1Q9NYZ3 720 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 RAB23Q9ULC3 237 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 GARTP22102 1010 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 CASP5P51878 434 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 ALCAMQ13740 583 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 BRSK2Q8IWQ3 736 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 PI4K2AQ9BTU6 479 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 SLC46A2Q9BY10 475 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 EPC1Q9H2F5 836 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 OLFML3Q9NRN5 406 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 BFSP1Q12934 665 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 CCDC65Q8IXS2 484 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 TMEM206Q9H813 350 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 IL21Q9HBE4 155 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 TSC2P49815 1807 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 MYBPHLA2RUH7 354 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 EXTL3O43909 919 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 PRAMEF12O95522 483 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 AVPR1AP37288 418 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 WNT7BP56706 349 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 PLCB2Q00722 1185 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 SATB1Q01826 763 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 STK38Q15208 465 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 DGKKQ5KSL6 1271 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 PDCL2Q8N4E4 241 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 SPEM1Q8N4L4 309 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 MAB21L3Q8N8X9 362 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 C1orf127Q8N9H9 656 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 CBWD1Q9BRT8 395 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 PDE11AQ9HCR9 933 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 TMLHEQ9NVH6 421 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 GMEB2Q9UKD1 530 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 MTMR6Q9Y217 621 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC4-208ENST00000527680 GPR179Q6PRD1 2367 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC4-208ENST00000527680 A0A087X0B3 334 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC4-208ENST00000527680 TMEM191BP0C7N4 346 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC4-208ENST00000527680 WEE1P30291 646 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC4-208ENST00000527680 CTHP32929 405 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC4-208ENST00000527680 RBP5P82980 135 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC4-208ENST00000527680 MYL7Q01449 175 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC4-208ENST00000527680 TNK2Q07912 1038 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC4-208ENST00000527680 PON2Q15165 354 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC4-208ENST00000527680 LPAL2Q16609 132 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC4-208ENST00000527680 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC4-208ENST00000527680 CMTM8Q8IZV2 173 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC4-208ENST00000527680 ACBD6Q9BR61 282 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC4-208ENST00000527680 GKN1Q9NS71 199 aa24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms