RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 MACROD2A1Z1Q3 448 aa16.51■□□□□ 0.23
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TRPS1-206ENST00000517323 RPL9P32969 192 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
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TRPS1-206ENST00000517323 CEP57Q86XR8 500 aa16.51■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 RSPH1Q8WYR4 309 aa16.51■□□□□ 0.23
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TRPS1-206ENST00000517323 UNGP13051 313 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 CYP4A22Q5TCH4 519 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 FAM171A1Q5VUB5 890 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 LRRTM3Q86VH5 581 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 SLC2A14Q8TDB8 520 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 C11orf70Q9BRQ4 267 aa16.48■□□□□ 0.23
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TRPS1-206ENST00000517323 TMEM30AQ9NV96 361 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPS1-206ENST00000517323 MYO1AQ9UBC5 1043 aa16.48■□□□□ 0.23
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