RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYP2D6P10635 497 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTPN2P17706 415 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 MCCP23508 829 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ELF1P32519 619 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR1G1P47890 313 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC11A1P49279 550 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADAM17P78536 824 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM189BP81408 668 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 E2F1Q01094 437 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 DSG1Q02413 1049 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 TNK2Q07912 1038 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 CBLBQ13191 982 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 DSG2Q14126 1118 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 SEPT6Q14141 434 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARID5BQ14865 1188 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 CRY1Q16526 586 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIF19Q2TAC6 998 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 USP41Q3LFD5 358 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARSIQ5FYB1 569 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 VAX1Q5SQQ9 334 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 METTL7BQ6UX53 244 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 C12orf54Q6X4T0 127 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 THSD4Q6ZMP0 1018 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 C16orf86Q6ZW13 317 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYFIP1Q7L576 1253 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 SKAP1Q86WV1 359 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 GATAD2AQ86YP4 633 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 MCF2L2Q86YR7 1114 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 SDR42E1Q8WUS8 393 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 HMGB4Q8WW32 186 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 NLRP7Q8WX94 980 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 FOXJ1Q92949 421 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 PGBD4Q96DM1 585 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 FEM1CQ96JP0 617 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 COX4I2Q96KJ9 171 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZSWIM3Q96MP5 696 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ALPK1Q96QP1 1244 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPP1R16BQ96T49 567 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 AGAP2Q99490 1192 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 CORO1BQ9BR76 489 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM175Q9BSA9 504 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPR88Q9GZN0 384 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 AZI2Q9H6S1 392 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 RXFP1Q9HBX9 757 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ECHDC1Q9NTX5 307 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 TBC1D13Q9NVG8 400 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNTG2Q9NY99 539 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 FNIP2Q9P278 1114 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 KANSL3Q9P2N6 904 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 SEL1LQ9UBV2 794 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 TJP2Q9UDY2 1190 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 DNAJB4Q9UDY4 337 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 FBXW11Q9UKB1 542 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNX11Q9Y5W9 270 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 NOTCH3Q9UM47 2321 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 LCTP09848 1927 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 KNTC1P50748 2209 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A0U1RQF3 1178 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 H0Y8X5 98 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRRG1O14668 218 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 NRP1O14786 923 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 DHX15O43143 795 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF217O75362 1048 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 NR3C2P08235 984 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ITGA2BP08514 1039 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 POU2F2P09086 479 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 TSPY3P0CV98 308 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 TSPY8P0CW00 308 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 LIPCP11150 499 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 MYL4P12829 197 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 CKMT2P17540 419 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ABCB4P21439 1286 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCND2P30279 289 aa2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms