RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLIN1O60240 522 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 BRAFP15056 766 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 GATA3P23771 443 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 NEK3P51956 506 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 VAV2P52735 878 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 AK2P54819 239 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 WNT3P56703 355 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 RPS7P62081 194 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 RAB32Q13637 225 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TUBA3CQ13748 450 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 IQCB1Q15051 598 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 LONRF3Q496Y0 759 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TIGD2Q4W5G0 525 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 C3orf38Q5JPI3 329 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TUBA3EQ6PEY2 450 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 MICALCLQ6ZW33 695 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 GAS2L3Q86XJ1 694 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC15A4Q8N697 577 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNF152Q8N8N0 203 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PSD4Q8NDX1 1056 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 MOGAT1Q96PD6 335 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TBCBQ99426 244 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF747Q9BV97 191 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 COLEC11Q9BWP8 271 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SMOC2Q9H3U7 446 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SACM1LQ9NTJ5 587 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SRRDQ9UH36 339 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 OGDHLQ9ULD0 1010 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMX2Q9Y320 296 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 NOX1Q9Y5S8 564 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 RAD54BQ9Y620 910 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 COL4A3Q01955 1670 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PIPSLA2A3N6 862 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYO1CO00159 1063 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 NARSO43776 548 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 LPXNO60711 386 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 VPS4BO75351 444 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDKL5O76039 1030 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPDEFO95238 335 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 IL18RAPO95256 599 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 FOSP01100 380 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 INSRRP14616 1297 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTGS2P35354 604 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRIM2P49643 509 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF134P52741 427 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 MC2RQ01718 297 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 GUCY1B3Q02153 619 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 FPGSQ05932 587 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 DAG1Q14118 895 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SYCP2LQ5T4T6 812 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC30A10Q6XR72 485 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPR149Q86SP6 731 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 COLGALT2Q8IYK4 626 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADGRG5Q8IZF4 528 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM109AQ8N4B1 249 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SAMD3Q8N6K7 520 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR56A3Q8NH54 315 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC46A1Q96NT5 459 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 OSBPL9Q96SU4 736 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 NELL2Q99435 816 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 INTS13Q9NVM9 706 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 CAPN11Q9UMQ6 739 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM233B4DJY2 109 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 MATN3O15232 486 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 MT-ND5P03915 603 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SRGNP10124 158 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 IL1R1P14778 569 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 HTR3AP46098 478 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 RHBDL3P58872 404 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 RPS16P62249 146 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 TP53BP2Q13625 1128 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 NPY5RQ15761 445 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 GEN1Q17RS7 908 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC44A4Q53GD3 710 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 LY6G5CQ5SRR4 150 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 DCAF12L1Q5VU92 463 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGFL4Q6B9Z1 124 aa3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms