RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511595.5

FAM53C-209, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 3

Gene FAM53C, Length 551 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-209	ENST00000511595	MCL1	Q07820	350 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	KAT5	Q92993	513 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	SMO	Q99835	787 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595		F5H697	171 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	TTLL1	O95922	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	PRR35	P0CG20	571 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	PF4V1	P10720	104 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	JUP	P14923	745 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	VCAM1	P19320	739 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	NDUFV1	P49821	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	CCT8	P50990	548 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	EPHB1	P54762	984 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	DSC2	Q02487	901 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	GRM1	Q13255	1194 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	AKAP10	O43572	662 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	MAL	P21145	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	CTGF	P29279	349 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	RAB27A	P51159	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	TCF15	Q12870	199 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	REPS1	Q96D71	796 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM53C-209	ENST00000511595	ZNF213	O14771	459 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	TRIAP1	O43715	76 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	ABLIM3	O94929	683 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	GJB1	P08034	283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	PDC	P20941	246 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	KEL	P23276	732 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	CYP2C19	P33261	490 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	PROSER3	Q2NL68	480 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	KCNAB3	O43448	404 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	POU2F2	P09086	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	AKAP5	P24588	427 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	TBCC	Q15814	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM53C-209	ENST00000511595	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68

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