RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 SREBF1P36956 1147 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 GDNFP39905 211 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SLC6A9P48067 706 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 DCAF7P61962 342 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 UBE3AQ05086 875 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 GRIN1Q05586 938 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CHRNDQ07001 517 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MGAT5Q09328 741 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MTM1Q13496 603 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF827Q17R98 1081 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PHF19Q5T6S3 580 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PROSER1Q86XN7 944 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 DTX3Q8N9I9 347 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ARRDC4Q8NCT1 418 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CXorf38Q8TB03 319 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MYLIPQ8WY64 445 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ATP2A3Q93084 1043 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PKNOX2Q96KN3 472 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SOX7Q9BT81 388 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ADAM7Q9H2U9 754 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ARMT1Q9H993 441 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 NOD2Q9HC29 1040 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SMYD2Q9NRG4 433 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 IRAK4Q9NWZ3 460 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 UCKL1Q9NWZ5 548 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM160Q9NX00 188 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CPNE7Q9UBL6 633 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF212Q9UDV6 495 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 LTBP4Q8N2S1 1624 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 A6NCN8 305 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 OR2W5A6NFC9 320 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 BTN3A1O00481 513 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PODXLO00592 558 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 NRP1O14786 923 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ABHD16AO95870 558 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 GNAI3P08754 354 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CNPP09543 421 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP2.55□□□□□ -25e-7■■■□□ 17.8
PDE4D-218ENST00000509368 ALOX12P18054 663 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 EGR1P18146 543 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 IL1R2P27930 398 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 HOXD12P35452 270 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 FLT3LGP49771 235 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 RPS16P62249 146 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 GNAI1P63096 354 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PFKPQ01813 784 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CCNG2Q16589 344 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SLC5A9Q2M3M2 681 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM60Q495X7 471 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 OLFML2BQ68BL8 750 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 GRAMD4Q6IC98 578 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PRR23BQ6ZRT6 265 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 LIX1LQ8IVB5 337 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ASB12Q8WXK4 309 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 TMX3Q96JJ7 454 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 WDR92Q96MX6 357 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 DIRC2Q96SL1 478 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 GPR35Q9HC97 309 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ZBTB26Q9HCK0 441 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 HECW1Q76N89 1606 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 A0A087WWL8 130 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 AQP7P3A6NL99 342 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 EFCAB8A8MWE9 144 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 F2RL2O00254 374 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 GPR32O75388 356 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CKMT1AP12532 417 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 GYPEP15421 78 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 DDCP20711 480 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MC4RP32245 332 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 LIFRP42702 1097 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PER3P56645 1201 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SOX8P57073 446 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 TCF15Q12870 199 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SLC13A2Q13183 592 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ANKRD1Q15327 319 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 BAK1Q16611 211 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ALDH1L2Q3SY69 923 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 RPTNQ6XPR3 784 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ETV3LQ6ZN32 361 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 GALNT5Q7Z7M9 940 aa2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms