RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
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PTPRK-215ENST00000498284 SLC13A2Q13183 592 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-215ENST00000498284 CTBP1Q13363 440 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRK-215ENST00000498284 PTPAQ15257 358 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRK-215ENST00000498284 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP5.48□□□□□ -1.53
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PTPRK-215ENST00000498284 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
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PTPRK-215ENST00000498284 NDUFV1P49821 464 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRK-215ENST00000498284 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRK-215ENST00000498284 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-215ENST00000498284 MOGAT1Q96PD6 335 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-215ENST00000498284 BTBD1Q9H0C5 482 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRK-215ENST00000498284 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-215ENST00000498284 A0A0B4J269 797 aa5.45□□□□□ -1.54
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PTPRK-215ENST00000498284 ZNF134P52741 427 aa5.45□□□□□ -1.54
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PTPRK-215ENST00000498284 CCDC146Q8IYE0 955 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-215ENST00000498284 MPP5Q8N3R9 675 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-215ENST00000498284 LCORLQ8N3X6 602 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-215ENST00000498284 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-215ENST00000498284 PHKBQ93100 1093 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-215ENST00000498284 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-215ENST00000498284 CASS4Q9NQ75 786 aa5.45□□□□□ -1.54
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