RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 TXLNAP40222 546 aa24.34■■□□□ 1.49
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TRDMT1-211ENST00000495022 WSCD1Q658N2 575 aa24.34■■□□□ 1.49
TRDMT1-211ENST00000495022 SPEM1Q8N4L4 309 aa24.34■■□□□ 1.49
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF560Q96MR9 790 aa24.34■■□□□ 1.49
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRC3BQ96PB8 259 aa24.34■■□□□ 1.49
TRDMT1-211ENST00000495022 IKZF4Q9H2S9 585 aa24.34■■□□□ 1.49
TRDMT1-211ENST00000495022 IL21Q9HBE4 155 aa24.34■■□□□ 1.49
TRDMT1-211ENST00000495022 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa24.33■■□□□ 1.49
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TRDMT1-211ENST00000495022 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa24.33■■□□□ 1.49
TRDMT1-211ENST00000495022 CTHP32929 405 aa24.33■■□□□ 1.49
TRDMT1-211ENST00000495022 PNPLA4P41247 253 aa24.33■■□□□ 1.49
TRDMT1-211ENST00000495022 CXCL12P48061 93 aa24.33■■□□□ 1.49
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TRDMT1-211ENST00000495022 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
TRDMT1-211ENST00000495022 RRAGBQ5VZM2 374 aa24.33■■□□□ 1.49
TRDMT1-211ENST00000495022 SV2BQ7L1I2 683 aa24.33■■□□□ 1.49
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRTM3Q86VH5 581 aa24.33■■□□□ 1.49
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TRDMT1-211ENST00000495022 SDK1Q7Z5N4 2213 aa24.33■■□□□ 1.49
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TRDMT1-211ENST00000495022 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 PRAMEF12O95522 483 aa24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 SDHBP21912 280 aa24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 SOX9P48436 509 aa24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 CYP4F8P98187 520 aa24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 SATB1Q01826 763 aa24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 TAF12Q16514 161 aa24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 DGKKQ5KSL6 1271 aa24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 GPIHBP1Q8IV16 184 aa24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 BPIFB1Q8TDL5 484 aa24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 ACCSQ96QU6 501 aa24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 OLFML3Q9NRN5 406 aa24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 GMEB2Q9UKD1 530 aa24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 RAB23Q9ULC3 237 aa24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 GREB1Q4ZG55 1949 aa24.32■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNA1Q09470 495 aa24.31■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 BRSK2Q8IWQ3 736 aa24.31■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 ZFYVE19Q96K21 471 aa24.31■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 GTSE1Q9NYZ3 720 aa24.31■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 LMNB2Q03252 620 aa24.3■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 ALCAMQ13740 583 aa24.3■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 TXNDC11Q6PKC3 985 aa24.3■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 CLIC6Q96NY7 704 aa24.3■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM213AQ9BRX8 229 aa24.3■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa24.3■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa24.3■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
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TRDMT1-211ENST00000495022 GCNT3O95395 438 aa24.29■■□□□ 1.48
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TRDMT1-211ENST00000495022 WDR44Q5JSH3 913 aa24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 LAIR1Q6GTX8 287 aa24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 GIPC2Q8TF65 315 aa24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC46A2Q9BY10 475 aa24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 TBC1D7Q9P0N9 293 aa24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 PTPRDP23468 1912 aa24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 FRMD3A2A2Y4 597 aa24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 TGM1P22735 817 aa24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 CDR1P51861 262 aa24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 CCINQ13939 588 aa24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 CMTM8Q8IZV2 173 aa24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 SYNPOQ8N3V7 929 aa24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 SAAL1Q96ER3 474 aa24.29■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 HELZP42694 1942 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 SOBPA7XYQ1 873 aa24.28■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 ITGB3P05106 788 aa24.28■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 SYT1P21579 422 aa24.28■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 CNR2P34972 360 aa24.28■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 CASP5P51878 434 aa24.28■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 WNT7BP56706 349 aa24.28■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 PON2Q15165 354 aa24.28■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa24.28■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 Q6ZS52 159 aa24.28■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM150AQ86TG1 271 aa24.28■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM86AQ8N2M4 240 aa24.28■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 PDCL2Q8N4E4 241 aa24.28■■□□□ 1.48
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRC52Q8N7C0 313 aa24.28■■□□□ 1.48
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