RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494037.1

TSPAN7-208, Transcript of tetraspanin 7, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN7, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7-208ENST00000494037 STK4Q13043 487 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 GRM2Q14416 872 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 MGAT5BQ3V5L5 792 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 GAREM2Q75VX8 874 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 WDR49Q8IV35 697 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 C12orf56Q8IXR9 622 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 ADGRF2Q8IZF7 708 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 THEM5Q8N1Q8 247 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 XXYLT1Q8NBI6 393 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 RDH13Q8NBN7 331 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 LEMD2Q8NC56 503 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 STKLD1Q8NE28 680 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 PSMG2Q969U7 264 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 PKMYT1Q99640 499 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 CGRRF1Q99675 332 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 FOXQ1Q9C009 403 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 EXOC1Q9NV70 894 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 GDAP2Q9NXN4 497 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SNX9Q9Y5X1 595 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 MIA3Q5JRA6 1907 aa8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 PTPRDP23468 1912 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 OBSL1O75147 1896 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 HUS1O60921 280 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 LRRN2O75325 713 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 GLULP15104 373 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 RFX1P22670 979 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 GABRR2P28476 465 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 VIPR2P41587 438 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SYKP43405 635 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 CASP4P49662 377 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 NUBP1P53384 320 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 CYP4F8P98187 520 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 TSPY1Q01534 308 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 PSMD6Q15008 389 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SURF1Q15526 300 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SOWAHAQ2M3V2 549 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 VITQ6UXI7 678 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 CCDC105Q8IYK2 499 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 TMEM86AQ8N2M4 240 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 FSIP1Q8NA03 581 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SPPL2BQ8TCT7 592 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 PLEKHO2Q8TD55 490 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 GIPC2Q8TF65 315 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SMARCD2Q92925 531 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 ELSPBP1Q96BH3 223 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 CCDC127Q96BQ5 260 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 HPDLQ96IR7 371 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 IL21Q9HBE4 155 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 KIAA1586Q9HCI6 787 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 HSFX1Q9UBD0 423 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 USP25Q9UHP3 1055 aa8.9□□□□□ -0.98
TSPAN7-208ENST00000494037 DENND4CQ5VZ89 1909 aa8.9□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 A0A1W2PQ27 194 aa8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 A0A1W2PQ64 194 aa8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 A0A1W2PQD8 194 aa8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 SHISA7A6NL88 538 aa8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 STK25O00506 426 aa8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 GABRDO14764 452 aa8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 EXOC3O60645 756 aa8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 PRAMEF12O95522 483 aa8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 RPN1P04843 607 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 DCNP07585 359 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 TNNI1P19237 187 aa8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 TUFMP49411 452 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 MRE11P49959 708 aa8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 STARD6P59095 220 aa8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 MYL7Q01449 175 aa8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 PFKPQ01813 784 aa8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 SMARCB1Q12824 385 aa8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 DPYDQ12882 1025 aa8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 MYO1EQ12965 1108 aa8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 VEPH1Q14D04 833 aa8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC44A4Q53GD3 710 aa8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 SDHAF4Q5VUM1 108 aa8.89□□□□□ -0.99
TSPAN7-208ENST00000494037 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms