RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 FATE1Q969F0 183 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 CAPNS2Q96L46 248 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 MYD88Q99836 296 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 DBNDD1Q9H9R9 158 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 IFT122Q9HBG6 1241 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 MKS1Q9NXB0 559 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 SORCS3Q9UPU3 1222 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 SPEF1Q9Y4P9 236 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 MRFAP1Q9Y605 127 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 COL24A1Q17RW2 1714 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 CNTNAP1P78357 1384 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 UBR3Q6ZT12 1888 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 GABRDO14764 452 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 AKR1B10O60218 316 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 RECQL4O94761 1208 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 UFL1O94874 794 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 MT-CO1P00395 513 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 ADH4P08319 380 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 CRHR1P34998 444 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 MTNR1BP49286 362 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 HMGA2P52926 109 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 RPS8P62241 208 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 GPSM2P81274 684 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 TNIP1Q15025 636 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 ADRM1Q16186 407 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 CST9Q5W186 159 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF276Q8N554 614 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 C8orf58Q8NAV2 365 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC17A8Q8NDX2 589 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 MDM1Q8TC05 714 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF480Q8WV37 535 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 SSH1Q8WYL5 1049 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 GCC1Q96CN9 775 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 CLIP3Q96DZ5 547 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 FAXDC2Q96IV6 333 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 CEP89Q96ST8 783 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 BABAM1Q9NWV8 329 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 HYPKQ9NX55 129 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 CLCA2Q9UQC9 943 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 GPR45Q9Y5Y3 372 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 TJP1Q07157 1748 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 QSER1Q2KHR3 1735 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 KLHL33A6NCF5 533 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 TBKBP1A7MCY6 615 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 YDJCA8MPS7 323 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 B5MCH6 92 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 ADM5C9JUS6 153 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 PSMD14O00487 310 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 TRIM24O15164 1050 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 ADCY6O43306 1168 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 ECE2O60344 883 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 RBP3P10745 1247 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 OSMP13725 252 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 AGXTP21549 392 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 CCND1P24385 295 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 PTPN7P35236 360 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 PTGS2P35354 604 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 PTTG1IPP53801 180 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 GNAI1P63096 354 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 ACAP2Q15057 778 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 CSRP2Q16527 193 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 PTPN21Q16825 1174 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 ABCB5Q2M3G0 1257 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 MST1LQ2TV78 715 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 MUM1L1Q5H9M0 696 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 MFSD14BQ5SR56 506 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 ANKS6Q68DC2 871 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 Q6ZVL8 140 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-211ENST00000492895 AMER2Q8N7J2 671 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms