RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP13.6□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 EXD1Q8NHP7 514 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 MAIP1Q8WWC4 291 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 OPTNQ96CV9 577 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 OSBPL7Q9BZF2 842 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 CDT1Q9H211 546 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 FZD8Q9H461 694 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 CYTH4Q9UIA0 394 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 SPDYE5A6NIY4 337 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 CXCL11O14625 94 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 GAS8O95995 478 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 NFICP08651 508 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 MMP13P45452 471 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 C6orf89Q6UWU4 347 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 SEC16BQ96JE7 1060 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 SIX4Q9UIU6 781 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 DNPEPQ9ULA0 475 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 ANK1P16157 1881 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 KRT1P04264 644 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 PAEPP09466 180 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 ELF1P32519 619 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 AP3M2P53677 418 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 MBTD1Q05BQ5 628 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 ERMARDQ5T6L9 678 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 ZNF365Q70YC5 407 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 GSTA5Q7RTV2 222 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 ERICH1Q86X53 443 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 TMEM35BQ8NCS4 154 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 SLITRK1Q96PX8 696 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 SDCBP2Q9H190 292 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 GRM1Q13255 1194 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 WDR72Q3MJ13 1102 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 IZUMO3Q5VZ72 239 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 EXOC3L1Q86VI1 746 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 JOSD2Q8TAC2 188 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 GRK7Q8WTQ7 553 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 CPB2Q96IY4 423 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 C9orf72Q96LT7 481 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 TWNKQ96RR1 684 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 TMEM109Q9BVC6 243 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 C10orf88Q9H8K7 445 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 NINJ2Q9NZG7 142 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 HMGXB4Q9UGU5 601 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 LACTBL1A8MY62 500 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 NEBLO76041 1014 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 TNNC2P02585 160 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 DRD4P21917 467 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 GJA5P36382 358 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 IFNAR2P48551 515 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 ACCSLQ4AC99 568 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 PTPN20Q4JDL3 420 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 C2orf40Q9H1Z8 148 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 KCNH4Q9UQ05 1017 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 A0A087WZ62 844 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 TTC4O95801 387 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 AGTP01019 485 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 CALB1P05937 261 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 INSRRP14616 1297 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 KLRC2P26717 231 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 CDR1P51861 262 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 C1orf127Q8N9H9 656 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 TRAIPQ9BWF2 469 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 FAM129AQ9BZQ8 928 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 SMYD3Q9H7B4 428 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 GGT7Q9UJ14 662 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 LRRD1A4D1F6 860 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 CHUKO15111 745 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 B4GALT4O60513 344 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 C22orf31O95567 290 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 VTNP04004 478 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 SMTNL2Q2TAL5 461 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 P3H1Q32P28 736 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 CCDC125Q86Z20 511 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 RCOR2Q8IZ40 523 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 EMC1Q8N766 993 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 IFT122Q9HBG6 1241 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 MCM8Q9UJA3 840 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 GGA2Q9UJY4 613 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-213ENST00000492657 ZNF148Q9UQR1 794 aa13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms