RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	NME7	Q9Y5B8	376 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	TACC1	O75410	805 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	POU2F2	P09086	479 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	MYL7	Q01449	175 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	DUSP4	Q13115	394 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	TAF4B	Q92750	862 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	PKMYT1	Q99640	499 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TTC3-223	ENST00000492275	STX10	O60499	249 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	CBWD6	Q4V339	395 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	SEMA4D	Q92854	862 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	SDCBP2	Q9H190	292 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	27.63	■■■□□ 2.01	5e-7	■■■■■ 51.8
TTC3-223	ENST00000492275		A0A0C4DFX4	3053 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	VCAN	P13611	3396 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	ATP2C2	O75185	946 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	MXI1	P50539	228 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	CDH8	P55286	799 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	TSPY1	Q01534	308 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	XYLB	O75191	536 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	PDGFRB	P09619	1106 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	PCSK1	P29120	753 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	NTHL1	P78549	312 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC142	Q17RM4	750 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	GJD3	Q8N144	294 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	SNX25	Q9H3E2	840 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	GNA14	O95837	355 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	LRG1	P02750	347 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	RAP1GAP	P47736	663 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	TWF1	Q12792	350 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	SMARCB1	Q12824	385 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	FAM171B	Q6P995	826 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	CEP72	Q9P209	647 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	CDH9	Q9ULB4	789 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	YIPF1	Q9Y548	306 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	NCOR1	O75376	2440 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	CLUH	O75153	1309 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	MYO10	Q9HD67	2058 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	SOAT2	O75908	522 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	CLSTN1	O94985	981 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	ASPA	P45381	313 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	SYT15	Q9BQS2	421 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	RAB20	Q9NX57	234 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	DACH1	Q9UI36	760 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	FMO5	P49326	533 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	PTPRD	P23468	1912 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC3-223	ENST00000492275	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC3-223	ENST00000492275	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
TTC3-223	ENST00000492275	P4HA1	P13674	534 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC3-223	ENST00000492275	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
TTC3-223	ENST00000492275	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
TTC3-223	ENST00000492275	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC3-223	ENST00000492275	BCO2	Q9BYV7	579 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC3-223	ENST00000492275	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		27.57	■■■□□ 2

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