RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490510.5

PITRM1-211, Transcript of pitrilysin metallopeptidase 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITRM1, Length 778 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1-211ENST00000490510 TCHHQ07283 1943 aa20.64■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 ARNTLO00327 626 aa20.63■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 ZNF263O14978 683 aa20.63■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 ASIC1P78348 528 aa20.63■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 SMARCB1Q12824 385 aa20.63■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.63■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.63■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 IQUBQ8NA54 791 aa20.63■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.63■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 GIPC2Q8TF65 315 aa20.63■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 LRRC3BQ96PB8 259 aa20.63■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.63■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.63■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 PTPRJQ12913 1337 aa20.62■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 MAN2B1O00754 1011 aa20.62■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 LAMTOR5O43504 91 aa20.62■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 F13A1P00488 732 aa20.62■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 MAGEA9P43362 315 aa20.62■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 CYP4F8P98187 520 aa20.62■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 AMPD3Q01432 767 aa20.62■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 BFSP1Q12934 665 aa20.62■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 PKP1Q13835 747 aa20.62■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 VEPH1Q14D04 833 aa20.62■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 GPR158Q5T848 1215 aa20.62■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.62■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.62■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 OSTM1Q86WC4 334 aa20.62■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.62■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 E2F7Q96AV8 911 aa20.62■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.62■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 SEMA4AQ9H3S1 761 aa20.62■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 PIAS3Q9Y6X2 628 aa20.62■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 FANCMQ8IYD8 2048 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 NCAM2O15394 837 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 FGF19O95750 216 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 LMNAP02545 664 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 KRT19P08727 400 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 TMEM191BP0C7N4 346 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 CASP1P29466 404 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 RPS9P46781 194 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 GPR15P49685 360 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 RBP5P82980 135 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 TSPY1Q01534 308 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 FCHO2Q0JRZ9 810 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 INTS13Q9NVM9 706 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 GDAP2Q9NXN4 497 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 FBXO4Q9UKT5 387 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 COL4A2P08572 1712 aa20.61■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 ZNF233A6NK53 670 aa20.6■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 CHADO15335 359 aa20.6■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 TGFB1I1O43294 461 aa20.6■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 HCRTO43612 131 aa20.6■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 HUS1O60921 280 aa20.6■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 PRAMEF12O95522 483 aa20.6■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 CCDC142Q17RM4 750 aa20.6■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.6■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.6■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 YAF2Q8IY57 180 aa20.6■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.6■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 FAM3CQ92520 227 aa20.6■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 PKMYT1Q99640 499 aa20.6■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 ACBD6Q9BR61 282 aa20.6■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.6■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 TASP1Q9H6P5 420 aa20.6■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa20.6■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 ZNF292O60281 2723 aa20.59■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 CDC25CP30307 473 aa20.59■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 EHHADHQ08426 723 aa20.59■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 MTAPQ13126 283 aa20.59■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 ZNF528Q3MIS6 628 aa20.59■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.59■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 UNC13DQ70J99 1090 aa20.59■□□□□ 0.89
PITRM1-211ENST00000490510 TMEM150AQ86TG1 271 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms