RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 MGAT5BQ3V5L5 792 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 CYP4A22Q5TCH4 519 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 SLC44A3Q8N4M1 653 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 FGF14Q92915 247 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 SMARCE1Q969G3 411 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 PBXIP1Q96AQ6 731 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 EEF2KMTQ96G04 330 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 MMS19Q96T76 1030 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 ASAH2Q9NR71 780 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 RMND1Q9NWS8 449 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 GABRDO14764 452 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 ATP2C2O75185 946 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 MOSPD3O75425 235 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 AKAP3O75969 853 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 CLSTN1O94985 981 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 ATF6P18850 670 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 LMO2P25791 158 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 EPHB3P54753 998 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 CLDN10P78369 228 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 NFIL3Q16649 462 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 WDR72Q3MJ13 1102 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 ZCWPW2Q504Y3 356 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 C1orf220Q5T0J3 134 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 ISM2Q6H9L7 571 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 LIMS2Q7Z4I7 341 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 SPATA20Q8TB22 786 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 FAM200AQ8TCP9 573 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 GPR152Q8TDT2 470 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 GIPC2Q8TF65 315 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 GSDMAQ96QA5 445 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 KXD1Q9BQD3 176 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 LPIN3Q9BQK8 851 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 ACBD6Q9BR61 282 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 PI4K2AQ9BTU6 479 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 XYLT2Q9H1B5 865 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 GTF3C4Q9UKN8 822 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 DUSP12Q9UNI6 340 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 ZNF318Q5VUA4 2279 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 MYBPHLA2RUH7 354 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 ZNF197O14709 1029 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 VNN1O95497 513 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 PDGFRBP09619 1106 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 TRIM49P0CI25 452 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 TRIM49CP0CI26 452 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 LHX1P48742 406 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 TUFMP49411 452 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 GPR15P49685 360 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 AP3M2P53677 418 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 EPHA5P54756 1037 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 TNNC1P63316 161 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 ADAM9Q13443 819 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 NCOA4Q13772 614 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 SDHAF4Q5VUM1 108 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 DPH6Q7L8W6 267 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 TMC8Q8IU68 726 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 FAM186BQ8IYM0 893 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 STKLD1Q8NE28 680 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 SHKBP1Q8TBC3 707 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 SPATA18Q8TC71 538 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 SPPL2BQ8TCT7 592 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 TMC2Q8TDI7 906 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 NXPE3Q969Y0 559 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 ZSWIM3Q96MP5 696 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 PKMYT1Q99640 499 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 LRRC3Q9BY71 257 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 GDE1Q9NZC3 331 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 HSFX1Q9UBD0 423 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 MAN1B1Q9UKM7 699 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 NME7Q9Y5B8 376 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 A0A1W2PRU2 124 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 MAPK13O15264 365 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 CFHP08603 1231 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 WARSP23381 471 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 CYP2F1P24903 491 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 RPL13P26373 211 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 PCSK1P29120 753 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 ATICP31939 592 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
NISCH-214ENST00000490425 VAMP7P51809 220 aa12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms