RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486274.5

TBC1D23-208, Transcript of TBC1 domain family member 23, human

TSL 5

Gene TBC1D23, Length 4,054 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D23-208	ENST00000486274	LENG9	Q96B70	501 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	TH	P07101	528 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	CCDC130	P13994	396 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	MLH1	P40692	756 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	ARL4C	P56559	192 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	TPI1	P60174	286 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	CDK17	Q00537	523 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	ADAM2	Q99965	735 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274		A0A0G2JND7	137 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	PRRG1	O14668	218 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	KCNA2	P16389	499 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62	2e-7	■□□□□ 9
TBC1D23-208	ENST00000486274	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	KCNJ6	P48051	423 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	PSEN2	P49810	448 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	SCNN1G	P51170	649 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	RABGGTB	P53611	331 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	TERF2	Q15554	542 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRADD	Q15628	312 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	CACNA1F	O60840	1977 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TBC1D23-208	ENST00000486274	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	IL18RAP	O95256	599 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	PML	P29590	882 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	ITGA8	P53708	1063 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	BAP1	Q92560	729 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZIM3	Q96PE6	472 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	CDT1	Q9H211	546 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	TREH	O43280	583 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	TLR2	O60603	784 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	ARIH2	O95376	493 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	FAM200B	P0CF97	657 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	HTRA3	P83110	453 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	FIGN	Q5HY92	759 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	LRRC31	Q6UY01	552 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	MAML1	Q92585	1016 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	OPLAH	O14841	1288 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	CD4	P01730	458 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	AKR1A1	P14550	325 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	ANO4	Q32M45	955 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	APOL1	O14791	398 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	CLGN	O14967	610 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZNF263	O14978	683 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	SH3BP5	O60239	455 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	KCNA3	P22001	575 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	GTF2B	Q00403	316 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	IL9R	Q01113	521 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	HIPK4	Q8NE63	616 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	GPR152	Q8TDT2	470 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TBC1D23-208	ENST00000486274	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63

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