RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486223.1

FREM1-208, Transcript of FRAS1 related extracellular matrix 1, human

TSL 3

Gene FREM1, Length 815 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FREM1-208	ENST00000486223	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	TSPOAP1	O95153	1857 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	CFTR	P13569	1480 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223		F5H697	171 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	GABRD	O14764	452 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	ANXA1	P04083	346 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	PHKA1	P46020	1223 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	PIGF	Q07326	219 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	TBCC	Q15814	346 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	KIF20A	O95235	890 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	TTLL1	O95922	423 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	KEL	P23276	732 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	CTGF	P29279	349 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	PRDX5	P30044	214 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	LIPA	P38571	399 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	ZNF134	P52741	427 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	GRM1	Q13255	1194 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	MTMR1	Q13613	665 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	ACAP2	Q15057	778 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	SMO	Q99835	787 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	WIZ	O95785	1651 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223		H0YIZ8	118 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	DCLK1	O15075	740 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	PPM1D	O15297	605 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	ORC4	O43929	436 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	VPS4B	O75351	444 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	MOSPD3	O75425	235 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	CPE	P16870	476 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	EPHB2	P29323	1055 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	CNGA1	P29973	690 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	WASF1	Q92558	559 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	ABCC8	Q09428	1581 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	TOPBP1	Q92547	1522 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	MYO1F	O00160	1098 aa		4.03	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	NTN1	O95631	604 aa		4.03	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.03	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	KIF22	Q14807	665 aa		4.03	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.03	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.03	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.03	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.03	□□□□□ -1.76
FREM1-208	ENST00000486223	SYNJ2	O15056	1496 aa		4.03	□□□□□ -1.76

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