RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
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USP40-215ENST00000484528 PDE11AQ9HCR9 933 aa23.23■■□□□ 1.31
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USP40-215ENST00000484528 HSFX1Q9UBD0 423 aa23.23■■□□□ 1.31
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USP40-215ENST00000484528 CEP250Q9BV73 2442 aa23.23■■□□□ 1.31
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USP40-215ENST00000484528 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
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USP40-215ENST00000484528 ATRIPQ8WXE1 791 aa23.17■■□□□ 1.3
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