RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 TBC1D16Q8TBP0 767 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 CHFRQ96EP1 664 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD2Q9GZV1 360 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 BOLA2Q9H3K6 86 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 PRSS50Q9UI38 385 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 XDHP47989 1333 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1B0GUL6 1792 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 LRP5O75197 1615 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF609O15014 1411 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 CFBP00751 764 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 GYPEP15421 78 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 GYS2P54840 703 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 INHBCP55103 352 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 WNT3AP56704 352 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 UBE4AQ14139 1066 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 HTR3DQ70Z44 454 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 TAS1R1Q7RTX1 841 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 RSAD2Q8WXG1 361 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 LPIN2Q92539 896 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
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PTPRC-211ENST00000484135 IFT22Q9H7X7 185 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 GPR108Q9NPR9 543 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 ECHDC1Q9NTX5 307 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 SORCS3Q9UPU3 1222 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 SALL3Q9BXA9 1300 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 DLEC1Q9Y238 1755 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PR48 441 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 GOLIM4O00461 696 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 DNAJC6O75061 913 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 ULK1O75385 1050 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 LPLP06858 475 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
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PTPRC-211ENST00000484135 GZMKP49863 264 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 DPTQ07507 201 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 STRN3Q13033 797 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 DHCR24Q15392 516 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 PTPROQ16827 1216 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC93Q567U6 631 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 CT83Q5H943 113 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC158Q5M9N0 1113 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRC-211ENST00000484135 RASSF3Q86WH2 238 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF276Q8N554 614 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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PTPRC-211ENST00000484135 MXD3Q9BW11 206 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 ENKD1Q9H0I2 346 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 KCTD10Q9H3F6 313 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 DBNDD1Q9H9R9 158 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 STAP2Q9UGK3 403 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 DUOX1Q9NRD9 1551 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 A0A087X1B8 175 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 PPIP5K2O43314 1243 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 RECQL4O94761 1208 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 BPIP17213 487 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ATP5JP18859 108 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ID4P47928 161 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 PRELPP51888 382 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 LGALS4P56470 323 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 GPR162Q16538 588 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CAVIN4Q5BKX8 364 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 PITRM1Q5JRX3 1037 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 RNF180Q86T96 592 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 THNSL2Q86YJ6 484 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CPT1CQ8TCG5 803 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 HAS1Q92839 578 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 GPATCH3Q96I76 525 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CEP89Q96ST8 783 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 PDCD2LQ9BRP1 358 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 IKZF4Q9H2S9 585 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 WDR26Q9H7D7 661 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CD209Q9NNX6 404 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 GPRC5BQ9NZH0 403 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 HMG20BQ9P0W2 317 aa5.64□□□□□ -1.51
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