RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475208.5

TMEM54-205, Transcript of transmembrane protein 54, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM54, Length 768 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54-205ENST00000475208 THEM5Q8N1Q8 247 aa26.91■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 GIPC2Q8TF65 315 aa26.91■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 C2orf42Q9NWW7 574 aa26.91■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 STYXL1Q9Y6J8 313 aa26.91■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 DCDC2BA2VCK2 349 aa26.9■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 LRP3O75074 770 aa26.9■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 MCM2P49736 904 aa26.9■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 WSCD1Q658N2 575 aa26.9■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 LRRTM3Q86VH5 581 aa26.9■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 EFCAB13Q8IY85 973 aa26.9■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 SPPL2BQ8TCT7 592 aa26.9■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 IKZF4Q9H2S9 585 aa26.9■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa26.9■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 CNR2P34972 360 aa26.89■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 SMARCB1Q12824 385 aa26.89■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 CCINQ13939 588 aa26.89■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 SLC46A2Q9BY10 475 aa26.89■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 CCSER1Q9C0I3 900 aa26.89■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa26.88■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 BRAPQ7Z569 592 aa26.88■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 SFR1Q86XK3 245 aa26.88■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 POMGNT1Q8WZA1 660 aa26.88■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 SEMA4GQ9NTN9 838 aa26.88■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 TCHHQ07283 1943 aa26.88■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 DDIT3P35638 169 aa26.87■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 SV2CQ496J9 727 aa26.87■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 SYNPOQ8N3V7 929 aa26.87■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 NETO1Q8TDF5 533 aa26.87■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 ZNF560Q96MR9 790 aa26.87■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 KPNA7A9QM74 516 aa26.86■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 HOXC13P31276 330 aa26.86■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 DYMQ7RTS9 669 aa26.86■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 ZNF720Q7Z2F6 126 aa26.86■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 CMTM8Q8IZV2 173 aa26.86■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 HVCN1Q96D96 273 aa26.86■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa26.86■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa26.86■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 GKN1Q9NS71 199 aa26.86■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 ZMYM5Q9UJ78 669 aa26.86■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 IL18RAPO95256 599 aa26.85■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 ADSSP30520 456 aa26.85■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 HOXA6P31267 233 aa26.85■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 PRR23CQ6ZRP0 262 aa26.85■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 USP49Q70CQ1 688 aa26.85■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 CEP68Q76N32 757 aa26.85■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 TMEM150AQ86TG1 271 aa26.85■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 WDR5BQ86VZ2 330 aa26.85■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 EPSTI1Q96J88 318 aa26.85■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 TMLHEQ9NVH6 421 aa26.85■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa26.85■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 SLC30A4O14863 429 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 PPP1R37O75864 691 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 AVPR1AP37288 418 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 NLRP12P59046 1061 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 POSTNQ15063 836 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 PTPAQ15257 358 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 CSRP2Q16527 193 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 NT5DC4Q86YG4 428 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 MAB21L3Q8N8X9 362 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 FAM83CQ9BQN1 747 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 HPS4Q9NQG7 708 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 CCL26Q9Y258 94 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 EXTL3O43909 919 aa26.83■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 F11P03951 625 aa26.83■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 PNPLA4P41247 253 aa26.83■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 GPR15P49685 360 aa26.83■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 WNT7BP56706 349 aa26.83■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 TSPY1Q01534 308 aa26.83■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 BFSP1Q12934 665 aa26.83■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 PKN3Q6P5Z2 889 aa26.83■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 STKLD1Q8NE28 680 aa26.83■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 FAM213AQ9BRX8 229 aa26.83■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 PI4K2AQ9BTU6 479 aa26.83■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 STK17AQ9UEE5 414 aa26.83■■□□□ 1.89
TMEM54-205ENST00000475208 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP26.82■■□□□ 1.88
TMEM54-205ENST00000475208 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
TMEM54-205ENST00000475208 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
TMEM54-205ENST00000475208 KCNA1Q09470 495 aa26.82■■□□□ 1.88
TMEM54-205ENST00000475208 RUNX3Q13761 415 aa26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms