RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 CDH7Q9ULB5 785 aa22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 IKBKBO14920 756 aa22.23■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 GPR37L1O60883 481 aa22.23■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 PCSK1P29120 753 aa22.23■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 EPHB3P54753 998 aa22.23■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 STIM1Q13586 685 aa22.23■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 NCOA4Q13772 614 aa22.23■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.23■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.23■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 ING5Q8WYH8 240 aa22.23■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 FGF13Q92913 245 aa22.23■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.23■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 KCNK12Q9HB15 430 aa22.23■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.23■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 PSMA7O14818 248 aa22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 CETN3O15182 167 aa22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 HCRTO43612 131 aa22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 SOAT2O75908 522 aa22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 VNN1O95497 513 aa22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 WARSP23381 471 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 TUFMP49411 452 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 ZNF699Q32M78 642 aa22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 ZACNQ401N2 412 aa22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 ASAH2Q9NR71 780 aa22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.22■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.21■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.21■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 BIN1O00499 593 aa22.21■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 ZNF197O14709 1029 aa22.21■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 TRIM49P0CI25 452 aa22.21■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 TRIM49CP0CI26 452 aa22.21■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 PPP1R2P41236 205 aa22.21■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 LRRC63Q05C16 580 aa22.21■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 ENPEPQ07075 957 aa22.21■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 PRSS36Q5K4E3 855 aa22.21■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.21■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.21■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 SV2AQ7L0J3 742 aa22.21■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.21■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.21■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 PKMYT1Q99640 499 aa22.21■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.21■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.21■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 TACC1O75410 805 aa22.2■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 MYL4P12829 197 aa22.2■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
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VARS-218ENST00000459667 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 SIGLEC14Q08ET2 396 aa22.2■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 TDGQ13569 410 aa22.2■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 MORC3Q14149 939 aa22.2■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.2■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 LEMD2Q8NC56 503 aa22.2■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 TCEAL4Q96EI5 215 aa22.2■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 SYT15Q9BQS2 421 aa22.2■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 SNX25Q9H3E2 840 aa22.2■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.2■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.2■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 CDH9Q9ULB4 789 aa22.2■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 ASB3Q9Y575 518 aa22.2■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 TECTAO75443 2155 aa22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 PRR33A8MZF0 331 aa22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 ATF6P18850 670 aa22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 BMP6P22004 513 aa22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 LMO2P25791 158 aa22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 CCR2P41597 374 aa22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 PIK3CAP42336 1068 aa22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 GCLMP48507 274 aa22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 EPHA5P54756 1037 aa22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 PPP3CAQ08209 521 aa22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 HTR4Q13639 388 aa22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 VEPH1Q14D04 833 aa22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 CAMK4Q16566 473 aa22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 CCDC142Q17RM4 750 aa22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 ITIH5Q86UX2 942 aa22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
VARS-218ENST00000459667 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.19■■□□□ 1.14
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