RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIAA1841Q6NSI8 718 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STOX1Q6ZVD7 989 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHST3Q7LGC8 479 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HIPK4Q8NE63 616 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NUP43Q8NFH3 380 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TSPEARQ8WU66 669 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PGBD4Q96DM1 585 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SELENOOQ9BVL4 669 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MTMR4Q9NYA4 1195 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 L1RE1Q9UN81 338 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STX8Q9UNK0 236 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CENPFP49454 3210 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADGRA2Q96PE1 1338 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TCRBV5S2A0A599 114 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C19orf81C9J6K1 198 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACOT7O00154 380 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TLR2O60603 784 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 APOL3O95236 402 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GLI4P10075 376 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CTGFP29279 349 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GATA4P43694 442 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHRNEQ04844 493 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPIDRQ14159 915 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYB5R4Q7L1T6 521 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANKRD42Q8N9B4 389 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAP4K1Q92918 833 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PAGR1Q9BTK6 254 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 B3GNT5Q9BYG0 378 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF287Q9HBT7 754 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TXNRD2Q9NNW7 524 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBXO28Q9NVF7 368 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CTNNA3Q9UI47 895 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMX2Q9Y320 296 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYH4Q9Y623 1939 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 E7EWF7 191 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TTLL1O95922 423 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NDUFB10O96000 172 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRLP01236 227 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PFKMP08237 780 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FOSL1P15407 271 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRKCAP17252 672 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ROM1Q03395 351 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADCY2Q08462 1091 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IKZF1Q13422 519 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYBPC3Q14896 1274 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CASC1Q6TDU7 716 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C17orf99Q6UX52 265 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPNTQ6UXI9 565 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MISP3Q96FF7 219 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C12orf42Q96LP6 360 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC138Q96M89 665 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FOXB1Q99853 325 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADAMTS10Q9H324 1103 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRDM12Q9H4Q4 367 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VCPKMTQ9H867 229 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLIN4Q96Q06 1357 aa9.61□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 F5H6K3 240 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AOAHP28039 575 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IL12RB1P42701 662 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SNAP25P60880 206 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SP3Q02447 781 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLRC3Q07444 240 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANO6Q4KMQ2 910 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF220Q5VTB9 566 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLFN13Q68D06 897 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLFN12LQ6IEE8 588 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPPL2CQ8IUH8 684 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LYSMD2Q8IV50 215 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRT78Q8N1N4 520 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ESR2Q92731 530 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SGCZQ96LD1 299 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM47Q9BQJ4 181 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BHMT2Q9H2M3 363 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RSAD1Q9HA92 442 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CASS4Q9NQ75 786 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLAMF8Q9P0V8 285 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NYAP2Q9P242 653 aa9.6□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC154A6NI56 674 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CNMDO75829 334 aa9.59□□□□□ -0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FLOT1O75955 427 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms