RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453724.5

RPE-215, Transcript of ribulose-5-phosphate-3-epimerase, humanhuman

TSL 5

Gene RPE, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE-215ENST00000453724 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.66□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 MYO10Q9HD67 2058 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 SYCE3A1L190 88 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 SPDYE4A6NLX3 237 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 BECN2A8MW95 431 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 KCNJ18B7U540 433 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 I3L4J1 428 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 GABRDO14764 452 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 SPTLC1O15269 473 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 ABLIM3O94929 683 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 IL9P15248 144 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 ATF2P15336 505 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 ELF1P32519 619 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 OR1D2P34982 312 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 ZNF165P49910 485 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 MYL6P60660 151 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 ROR1Q01973 937 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 NHLH1Q02575 133 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 GCNT1Q02742 428 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 INCA1Q0VD86 236 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 KCNH2Q12809 1159 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 GPR17Q13304 367 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 ADAM15Q13444 863 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 KCNJ12Q14500 433 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 SOWAHAQ2M3V2 549 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 ANO6Q4KMQ2 910 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 CBWD6Q4V339 395 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 TCP11X2Q5H9J9 407 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 CBWD3Q5JTY5 395 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 CBWD5Q5RIA9 395 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 WSCD1Q658N2 575 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 CES5AQ6NT32 575 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 GBP6Q6ZN66 633 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 SMRP1Q8NCR6 262 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 TAS1R2Q8TE23 839 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 NECTIN4Q96NY8 510 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 NT5C1BQ96P26 610 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 PHOX2BQ99453 314 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 SNX25Q9H3E2 840 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 CLDND1Q9NY35 253 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 GCNT4Q9P109 453 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 CD207Q9UJ71 328 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 L1RE1Q9UN81 338 aa6.65□□□□□ -1.34
RPE-215ENST00000453724 ATP8B3O60423 1300 aa6.65□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.65□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 DMDP11532 3685 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 WDR27A2RRH5 827 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 PRR33A8MZF0 331 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 PRRG1O14668 218 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 PER2O15055 1255 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 TGM5O43548 720 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 XYLBO75191 536 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 TBX10O75333 385 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 CSPG5O95196 566 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 GLP2RO95838 553 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 ZNF18P17022 549 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 KCNA5P22460 613 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 MTHFRP42898 656 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 ASPAP45381 313 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 TUFMP49411 452 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 EXOC3L4Q17RC7 722 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 LEXMQ3ZCV2 418 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 VWA3BQ502W6 1294 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 ANKRD54Q6NXT1 300 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 LILRA6Q6PI73 481 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 ELMOD1Q8N336 334 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.64□□□□□ -1.35
RPE-215ENST00000453724 LEMD2Q8NC56 503 aa6.64□□□□□ -1.35
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