RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
PRAME-210ENST00000442481 CLDN3O15551 220 aa12.62□□□□□ -0.39
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PRAME-210ENST00000442481 ZNF131P52739 623 aa12.62□□□□□ -0.39
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PRAME-210ENST00000442481 GREB1Q4ZG55 1949 aa12.59□□□□□ -0.39
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PRAME-210ENST00000442481 MCL1Q07820 350 aa12.59□□□□□ -0.39
PRAME-210ENST00000442481 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP12.59□□□□□ -0.39
PRAME-210ENST00000442481 E2F4Q16254 413 aa12.59□□□□□ -0.39
PRAME-210ENST00000442481 SLC10A6Q3KNW5 377 aa12.59□□□□□ -0.39
PRAME-210ENST00000442481 GPR158Q5T848 1215 aa12.59□□□□□ -0.39
PRAME-210ENST00000442481 CENPPQ6IPU0 288 aa12.59□□□□□ -0.39
PRAME-210ENST00000442481 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
PRAME-210ENST00000442481 TMC8Q8IU68 726 aa12.59□□□□□ -0.39
PRAME-210ENST00000442481 CD302Q8IX05 232 aa12.59□□□□□ -0.39
PRAME-210ENST00000442481 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa12.59□□□□□ -0.39
PRAME-210ENST00000442481 SYCP3Q8IZU3 236 aa12.59□□□□□ -0.39
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