RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 PDZK1P1A8MUH7 402 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 PSMD14O00487 310 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 P4HA2O15460 535 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 KCNQ3O43525 872 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 RFC5P40937 340 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 STAT5BP51692 787 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 PTK7Q13308 1070 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.95□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 CCT8L2Q96SF2 557 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 WDR41Q9HAD4 459 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 F5H6K3 240 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 AIM2O14862 343 aa6.95□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 ERAP2Q6P179 960 aa6.95□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SLC20A1Q8WUM9 679 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 HPS3Q969F9 1004 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 WNK4Q96J92 1243 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 NLRP1Q9C000 1473 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 IGSF1Q8N6C5 1336 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 TBX3O15119 743 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 TRIM24O15164 1050 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 FYNP06241 537 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 VHLP40337 213 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 PEX5P50542 639 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SLC16A1P53985 500 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 CHRNB3Q05901 458 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 KYNUQ16719 465 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 RNF149Q8NC42 400 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 EXD1Q8NHP7 514 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 MBD2Q9UBB5 411 aa6.95□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 STON1Q9Y6Q2 735 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 DTNBO60941 627 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 HPGDP15428 266 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 ETFBP38117 255 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 COPAP53621 1224 aa6.95□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 TRIP10Q15642 601 aa6.95□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 PLA2G4FQ68DD2 849 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 WDR48Q8TAF3 677 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 ANKRD27Q96NW4 1050 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 CEP44Q9C0F1 390 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 PTPRKQ15262 1439 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 RRN3P2A6NIE6 340 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 NBPF26B4DH59 902 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 TIMM44O43615 452 aa6.95□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 LY9Q9HBG7 655 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa6.94□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 C19orf81C9J6K1 198 aa6.94□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 BIRC5O15392 142 aa6.94□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 FGFR4P22455 802 aa6.94□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 PPP2R1BP30154 601 aa6.94□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 STIP1P31948 543 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.94□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 GPR141Q7Z602 305 aa6.94□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa6.94□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.94□□□□□ -1.3
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