RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436928.7

SENP6-204, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 5

Gene SENP6, Length 595 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-204ENST00000436928 GKN1Q9NS71 199 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 SLC8A2Q9UPR5 921 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 ASB3Q9Y575 518 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 LACTBL1A8MY62 500 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 CLDN3O15551 220 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 AKAP3O75969 853 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 TYMPP19971 482 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 WEE1P30291 646 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 STRN3Q13033 797 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 SLC39A12Q504Y0 691 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 GIPC2Q8TF65 315 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 SENP8Q96LD8 212 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 VPS45Q9NRW7 570 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 C4orf47A7E2U8 309 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 FGF19O95750 216 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 CLTAP09496 248 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 ODC1P11926 461 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 LILRA4P59901 499 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 ANAPC15P60006 121 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 FOXC1Q12948 553 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 RUNX3Q13761 415 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 MGAT5BQ3V5L5 792 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 ZPBP2Q6X784 338 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 ITIH5Q86UX2 942 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 MAB21L3Q8N8X9 362 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 C17orf75Q9HAS0 396 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 DNM3Q9UQ16 869 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 ANTXRLA6NF34 631 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 PATE3B3GLJ2 98 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 NFICP08651 508 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 PLS3P13797 630 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 CYP3A5P20815 502 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 GUCY2CP25092 1073 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 CDC25CP30307 473 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 CREB5Q02930 508 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 PDIA5Q14554 519 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 JADE1Q6IE81 842 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 C8orf76Q96K31 380 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 HSFX1Q9UBD0 423 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 INVSQ9Y283 1065 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP6-204ENST00000436928 BPTFQ12830 3046 aa14.64□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 TADA3O75528 432 aa14.64□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 CAVIN2O95810 425 aa14.64□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 PI4KAP42356 2102 aa14.64□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 GPR15P49685 360 aa14.64□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 NLRP12P59046 1061 aa14.64□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 SPATA1Q5VX52 437 aa14.64□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.64□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 TXNDC8Q6A555 127 aa14.64□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 SLC39A4Q6P5W5 647 aa14.64□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.64□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 GATA6Q92908 595 aa14.64□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 GCNAQ96QF7 691 aa14.64□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.64□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 FASNP49327 2511 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 MYOFQ9NZM1 2061 aa14.64□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 ANO9A1A5B4 782 aa14.63□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 ATG13O75143 517 aa14.63□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 F11P03951 625 aa14.63□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 CYP11A1P05108 521 aa14.63□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 ADRB2P07550 413 aa14.63□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 GJA4P35212 333 aa14.63□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 GALK1P51570 392 aa14.63□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 NEK4P51957 841 aa14.63□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 SLC12A3P55017 1021 aa14.63□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 NCKAP1LP55160 1127 aa14.63□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 DMC1Q14565 340 aa14.63□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 VEPH1Q14D04 833 aa14.63□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 ELF2Q15723 593 aa14.63□□□□□ -0.07
SENP6-204ENST00000436928 ARMCX5Q6P1M9 558 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms