RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF507Q8TCN5 953 aa30.07■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 MTMR12Q9C0I1 747 aa30.07■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa30.07■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 TRPV5Q9NQA5 729 aa30.07■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 R4GN57 208 aa30.07■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa30.07■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 TGFB1I1O43294 461 aa30.06■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 GABRR2P28476 465 aa30.06■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 OSTM1Q86WC4 334 aa30.06■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa30.06■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa30.06■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 ITGA11Q9UKX5 1188 aa30.06■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP30.05■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 AMPD3Q01432 767 aa30.05■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 BFSP1Q12934 665 aa30.05■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM26FQ5R3K3 315 aa30.05■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 RESP18Q5W5W9 173 aa30.05■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF852Q6ZMS4 543 aa30.05■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 ITIH5Q86UX2 942 aa30.05■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 SPPL2BQ8TCT7 592 aa30.05■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 KCNG4Q8TDN1 519 aa30.05■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 GIPC2Q8TF65 315 aa30.05■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 IRF7Q92985 503 aa30.05■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 PKMYT1Q99640 499 aa30.05■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 BCO2Q9BYV7 579 aa30.05■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 ATXN3LQ9H3M9 355 aa30.05■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 INTS13Q9NVM9 706 aa30.05■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 GDAP2Q9NXN4 497 aa30.05■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 HSPBP1Q9NZL4 362 aa30.05■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa30.04■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 PATJQ8NI35 1801 aa30.04■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 SMARCB1Q12824 385 aa30.04■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC142Q17RM4 750 aa30.04■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa30.04■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 NELL2Q99435 816 aa30.04■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 BLZF1Q9H2G9 400 aa30.04■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 FANCMQ8IYD8 2048 aa30.03■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 HCRTO43612 131 aa30.03■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 GPR15P49685 360 aa30.03■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 RBP5P82980 135 aa30.03■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 GPR158Q5T848 1215 aa30.03■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 UNC13DQ70J99 1090 aa30.03■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 TMEM150AQ86TG1 271 aa30.03■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM200AQ8TCP9 573 aa30.03■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 SCFD1Q8WVM8 642 aa30.03■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 RCOR1Q9UKL0 485 aa30.03■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF233A6NK53 670 aa30.02■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 KRT19P08727 400 aa30.02■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 ME1P48163 572 aa30.02■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 CYP4F8P98187 520 aa30.02■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 FCHO2Q0JRZ9 810 aa30.02■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 LIMS2Q7Z4I7 341 aa30.02■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 E2F7Q96AV8 911 aa30.02■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 ACBD6Q9BR61 282 aa30.02■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa30.02■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa30.02■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 SNX9Q9Y5X1 595 aa30.02■■■□□ 2.4
TRIOBP-209ENST00000428075 GABRDO14764 452 aa30.01■■■□□ 2.39
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF263O14978 683 aa30.01■■■□□ 2.39
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TRIOBP-209ENST00000428075 VEPH1Q14D04 833 aa30.01■■■□□ 2.39
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TRIOBP-209ENST00000428075 PIAS3Q9Y6X2 628 aa30.01■■■□□ 2.39
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF292O60281 2723 aa30.01■■■□□ 2.39
TRIOBP-209ENST00000428075 MAGEA9P43362 315 aa30■■■□□ 2.39
TRIOBP-209ENST00000428075 TSPY1Q01534 308 aa30■■■□□ 2.39
TRIOBP-209ENST00000428075 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
TRIOBP-209ENST00000428075 NELFCDQ8IXH7 590 aa30■■■□□ 2.39
TRIOBP-209ENST00000428075 TOP6BLQ8N6T0 577 aa30■■■□□ 2.39
TRIOBP-209ENST00000428075 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
TRIOBP-209ENST00000428075 CHAMP1Q96JM3 812 aa30■■■□□ 2.39
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC46A2Q9BY10 475 aa30■■■□□ 2.39
TRIOBP-209ENST00000428075 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
TRIOBP-209ENST00000428075 TASP1Q9H6P5 420 aa30■■■□□ 2.39
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