RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417504.5

PTPA-211, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, humanhuman

TSL 4

Gene PTPA, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPA-211ENST00000417504 SLC9A7Q96T83 725 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 YME1L1Q96TA2 773 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 RNF19AQ9NV58 838 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 KANSL3Q9P2N6 904 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 VWA8A3KMH1 1905 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 ITIH6Q6UXX5 1313 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 COL4A6Q14031 1691 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 SERTM1A2A2V5 107 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 CASTOR2A6NHX0 329 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 PODXLO00592 558 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 PMM2O15305 246 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 AP5Z1O43299 807 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 OFD1O75665 1012 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 PTMAP06454 111 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 P4HA1P13674 534 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 IGFBP4P22692 258 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 PNPLA4P41247 253 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 GATMP50440 423 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 TNNC1P63316 161 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 FAM189BP81408 668 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 RBP5P82980 135 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 LRMPQ12912 555 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 TUSC3Q13454 348 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 RAPGEF1Q13905 1077 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 NR1I3Q14994 352 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 PTPN21Q16825 1174 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 SV2CQ496J9 727 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 EPC2Q52LR7 807 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 XKR4Q5GH76 650 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 ZNF667Q5HYK9 610 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 TMEM240Q5SV17 173 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 ALKAL1Q6UXT8 129 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 SPC24Q8NBT2 197 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 HERVK_113Q902F9 699 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 UROC1Q96N76 676 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 NUP58Q9BVL2 599 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.027e-6■■■■■ 74.5
PTPA-211ENST00000417504 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 RAB20Q9NX57 234 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 AGAP1Q9UPQ3 857 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 INPPL1O15357 1258 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 PRMT3O60678 531 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 VNN1O95497 513 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 F11P03951 625 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 SLC9A1P19634 815 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 PON1P27169 355 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 ATICP31939 592 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 OR1G1P47890 313 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 TAF6P49848 677 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 KLK7P49862 253 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 EPHB4P54760 987 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 MYL6P60660 151 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 C9orf57Q5W0N0 161 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 PPM1KQ8N3J5 372 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 LRRC52Q8N7C0 313 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 TAF4BQ92750 862 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 TOP1MTQ969P6 601 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 VWCEQ96DN2 955 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 HPDLQ96IR7 371 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 FAM81BQ96LP2 452 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 SPAG5Q96R06 1193 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 PI4K2AQ9BTU6 479 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 CXCL16Q9H2A7 254 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 PLCB1Q9NQ66 1216 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 MTMR10Q9NXD2 777 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 CEP72Q9P209 647 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 APEX2Q9UBZ4 518 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 SIK3Q9Y2K2 1263 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPA-211ENST00000417504 COQ4Q9Y3A0 265 aa8.69□□□□□ -1.02
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