RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 UBR7Q8N806 425 aa7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 SLC35G2Q8TBE7 412 aa7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF653Q96CK0 615 aa7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 HPDLQ96IR7 371 aa7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 APOL6Q9BWW8 343 aa7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 MCOLN1Q9GZU1 580 aa7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 THAP2Q9H0W7 228 aa7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 TAS2R14Q9NYV8 317 aa7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CNTN3Q9P232 1028 aa7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 RNF14Q9UBS8 474 aa7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 SIX4Q9UIU6 781 aa7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 AMFRQ9UKV5 643 aa7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CEP83Q9Y592 693 aa7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC85CA6NKD9 419 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 KBTBD13C9JR72 458 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 H3BM21 787 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 NCK2O43639 380 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 SRGAP2O75044 1071 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CAND2O75155 1236 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 RECQL4O94761 1208 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 MTA2O94776 668 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 UPP2O95045 317 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 LSM8O95777 96 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CYP1A2P05177 515 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 PAEPP09466 180 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ITGA4P13612 1032 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 KCNE1P15382 129 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CD19P15391 556 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CYP3A5P20815 502 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 AKAP5P24588 427 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 PNPLA4P41247 253 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF132P52740 706 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CENPCQ03188 943 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 TEX35Q5T0J7 233 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 UBXN11Q5T124 520 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 C6orf118Q5T5N4 469 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC70Q6NSX1 233 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ALKAL1Q6UXT8 129 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 SLFN11Q7Z7L1 901 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 FAM228AQ86W67 206 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 DNAAF5Q86Y56 855 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 LRRC52Q8N7C0 313 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 LRRC57Q8N9N7 239 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 USP38Q8NB14 1042 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF606Q8WXB4 792 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ARHGEF26Q96DR7 871 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 PBKQ96KB5 322 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CAPZA3Q96KX2 299 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 OSBPL9Q96SU4 736 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 MMS19Q96T76 1030 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 SELENOOQ9BVL4 669 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 TLR10Q9BXR5 811 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 BCO2Q9BYV7 579 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ACP6Q9NPH0 428 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 UVRAGQ9P2Y5 699 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 KIAA1257Q9ULG3 409 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 POLIQ9UNA4 740 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 IPPQ9Y573 584 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 TRIM17Q9Y577 477 aa7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 GRIN2DO15399 1336 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 SOBPA7XYQ1 873 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CES2O00748 559 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 KCNK3O14649 394 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 MAN1A2O60476 641 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 KIF4AO95239 1232 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CHRNA1P02708 482 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 TUBBP07437 444 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 SKIP12755 728 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 UNGP13051 313 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 RAB27AP51159 221 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 GUCY2FP51841 1108 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 MGAT3Q09327 533 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 PAK2Q13177 524 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ELF2Q15723 593 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 CLUL1Q15846 466 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC8-211ENST00000415409 ZBTB6Q15916 424 aa7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms